YM500v2是用于个人smRNA-seq数据集的miRNA定量,是miR鉴定和新型miRNA预测的集成数据库。YM500v2中包含了YM500之后开发的与miRNA相关的新算法,更重要的是,纳入了8000多个与癌症相关的smRNA-seq数据集(包括原发性肿瘤,成对的正常组织,PBMC,复发性肿瘤和转移性肿瘤的数据集)进入YM500v2。YM500v2数据来源于TCGA,主要是...
今天小诺就给大家介绍一个门户级别的网站,一次可以满足大家多个需求,这个数据库就是YM500v2 ▼▼▼ http://ngs.ym.edu.tw/ym500v2/index.php YM500v2 主要功能模块 ﹀ ﹀ ﹀ YM500v2打开的界面如下,我们可以看出主要包括了六个功能模块,分别是:已知miRNA表达水平查询、新的miRNA预测、miRNA异构体分析、5’和3...
YM500v2数据来源于TCGA,主要是收录RNA测序信息数据库,可用于microRNA研究,是miRNA的表达谱数据以及相关分析。YM500v2可用于靶基因预测、组间差异表达等分析进行处理。 YM500v2的新型miRNA(miRBase R21中未包括的miRNA)不仅可以通过三种独立的算法进行预测,而且可以通过一种新的计算机过滤策略进行清洗,并通过诸如交联免疫...
YM500v2数据来源于TCGA,主要是收录RNA测序信息数据库,可用于microRNA研究,是miRNA的表达谱数据以及相关分析。YM500v2可用于靶基因预测、组间差异表达等分析进行处理。 YM500v2的新型miRNA(miRBase R21中未包括的miRNA)不仅可以通过三种独立的算法进行预测,而且可以通过一种新的计算机过滤策略进行清洗,并通过诸如交联免疫...