软件主页:https://github.com/ruanjue/wtdbg2 1#安装wtdbg2 ## 手动安装 git clone https://github.com/ruanjue/wtdbg2 cd wtdbg2 && make ## 自动安装 conda install -c bioconda wtdbg 2#用wtdbg2进行初步组装 分两步,第一步是组装,第二步是得到一致性序列。 ## wtdbg2组装 /newlustre/home/jfgui...
使用conda安装 conda install-c bioconda canu-y 软件使用,来源不同的数据使用不同代码 #For PacBio:canu-p ecoli-d ecoli-pacbio genomeSize=4.8m-pacbio-raw pacbio.fastq#For Nanopore:canu-p ecoli-d ecoli-oxford genomeSize=4.8m-nanopore-raw oxford.fasta#Assembling PacBio HiFi with HiCanu:canu...