借助于Ks信息 (Ks值可以反应一定尺度内的演化时间),我们就可以较为容易地根据点阵图上共线性区域的颜色来区分多倍化事件。 首先,创建配置文件(这次是-bk模块,BlockKs) wgdi -bk\?>> ath.conf 然后,修改配置文件 [blockks]lens1=ath.lenlens2=ath.lengenome1_name=A. thalianagenome2_name=A. thalianablock...
借助于Ks信息 (Ks值可以反应一定尺度内的演化时间),我们就可以较为容易地根据点阵图上共线性区域的颜色来区分多倍化事件。 首先,创建配置文件(这次是-bk模块,BlockKs) wgdi -bk \?>>ath.conf 然后,修改配置文件 [blockks]lens1=ath.lenlens2=ath.lengenome1_name=A. thalianagenome2_name=A. thalianablock...
block_length: 一个共线区的最小基因对的数量,对应blockinfo中的length列 然后运行:wgdi -bk ath.V5.conf 输出图片中的Ks的取值范围由参数area控制。图中的每个点都是各个共线性区内的基因对的Ks值。不难发现每个共线区内的Ks的颜色都差不多,意味着Ks值波动不大。因此,我们在判定Ks峰值的时候,采用共线性区...
wgdi -bk total.conf 由于repeat_number的影响,近期加倍的片段影响较小,如果对古老多倍化的某些共线性感兴趣,强烈建议修改lens文件(去除一些染色体,保留感兴趣的染色体),针对性的计算dotplot和ks dotplot。 从ks dotplot可以清楚看到,共线性上ks值的变化。你会发现,近期加倍产生的共线性片段,ks的波动一般很小(有时...
导演BK 游侠网 游民星空 他的粉丝(3.2万) 用户7974090062 赵宸昊--_-- 蓝桉pm ocelot886 查看更多 a 微博精彩 热门微博热门话题 微博会员微相册 微游戏微指数 手机玩微博 扫码下载,更多版本戳这里 认证&合作 申请认证链接网站 企业微博微博营销 微博标识广告代理商 开放平台 微博帮助 常见问题 自助...
人物简介: 一、徐文兵担任职务:徐文兵目前担任汉台区民生家乐莲湖店欧莱雅专柜法定代表人;二、徐文兵投资情况:目前徐文兵投资汉台区民生家乐莲湖店欧莱雅专柜最终收益股份为0%;老板履历 图文概览商业履历 任职全景图 投资、任职的关联公司 商业关系图 一图看清商业版图 ...
破烂不堪 (pò làn bù kān) 简拼 plbk 近义词 破破烂烂 反义词 感情色彩 贬义词 成语结构 补充式 成语解释 破破烂烂的不成样子。 出处 清·李宝嘉《官场现形记》第二十回:“一时风气大变,没有一个不是穿的极破烂不堪的。” 成语用法 作谓语、定语、状语;用于口语 ...
wgdi -bk \? >> ath.V5.conf 其中:blockinfo 是前面共线性分析和Ks分析的整合结果。 pvalue: 共线性区的显著性, 对应blockinfo中的pvalue列 tandem: 是否过滤由串联基因所形成的共线性区,即点阵图中对角线部分 tandem_length: 如果过滤,那么评估tandem的标准就是两个区块的物理距离 ...
wgdi-bktotal.conf 由于repeat_number的影响,近期加倍的片段影响较小,如果对古老多倍化的某些共线性感兴趣,强烈建议修改lens文件(去除一些染色体,保留感兴趣的染色体),针对性的计算dotplot和ks dotplot。 从ks dotplot可以清楚看到,共线性上ks值的变化。你会发现,近期加倍产生的共线性片段,ks的波动一般很小(有时候...
wgdi-bktotal.conf 由于repeat_number的影响,近期加倍的片段影响较小,如果对古老多倍化的某些共线性感兴趣,强烈建议修改lens文件(去除一些染色体,保留感兴趣的染色体),针对性的计算dotplot和ks dotplot。 从ks dotplot可以清楚看到,共线性上ks值的变化。你会发现,近期加倍产生的共线性片段,ks的波动一般很小(有时候...