Git Lens: ファイル内の変更履歴や証跡を追うのに使えます。Remote SSH: SSH した環境をターミナル上ではなく、VSCode 上で使用することが出来ます。非常に強力で便利です。オススメです。(詳しくはこちらからRemote Development using SSH)
ここで使ったツールはghqというGitリポジトリ管理ツールです。散乱しがちなローカルリポジトリを~/.ghq/[hostname]/[user|org]/[repo]のディレクトリ構成で整理してくれます。 上記の例なら~/.ghq/github.com/jsk-report-template/ci-thesisとなります。