火山图（Volcano plot）是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p-value）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（代谢物等）。是一种单变量统计分析方法，常应用于研究基因组、转录组、代谢组、蛋白质组等数据分析。看懂火山图的要点VOLCANO PLOT在理...
火山图(Volcano plot)解析 火山图(Volcano plot)是散点图的一种,我们先把它简单分解一下,横坐标为logFC,纵坐标为-log10(adj P value),三条虚线将其分成了六部分。 在理解每一部分代表什么意思之前,我们需要先解决几个问题: 1.什么是-log10(adj P value):我们都知道P value是用来衡量检验得到的结果是否具...
火山图(Volcano Plot)形似火山喷发,是一种表示特征差异表达的散点图,它将统计测试中的统计显著性量度(如p value)和变化幅度相结合,从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点(基因等)。标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,差异越大的基因分布在两端。在生物信息分析中,火山图常用...
火山图(Volcano Plot)是一类用来展示组间差异数据的图像,因为在生物体发生变化时从全局角度而言大部分的基因表达没有或着发生了很小程度的变化,只有少部分基因的表达发生了显著的变化。故而,火山图常见于RNA表达谱和芯片的数据分析中,最常用于分析基因的差异表达,近年来也陆续有其他组学的应用,此处不做详述。
迈维云平台教程系列:火山图, 视频播放量 331、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 迈维代谢, 作者简介 ,相关视频:百图大战——(9)代谢物VIP图,【迈维云SCI作图18讲】第4讲:数据可视化工具-火山图,百图大战——(3)代谢物一级分类
1.8 Volcano PlotContents1 Summary 2 Tutorial SummaryThe Volcano Plot app can be used to create scatter plot of p-value versus fold change for microarray data. The graph is composed of six regions. The plot style for each region can be individually customized. ...
R语言:火山图(Volcano Plot) 两个实验组之间的若干个基因的差异倍数比较,可以通过 Volcano Plot 图形化展示。 例如DEseq2 对转录组测序的样品做差异基因分析之后,会得到一个基因表达差异的表格的。案例使用数据的来源是 GitHub:https://github.com/hbc/fabio-splicing/blob/master/new-samples/2016-07-29_fabio-...
新学期多点新知识 知识 校园学习 自学 数学 学习 火山图 p-value Volcano Plot 统计学 R语言 p值 新学期,多点新知识!7分钟学统计 发消息 比利时鲁汶大学统计系,深耕统计+医学领域。接下来播放 自动连播 标准差和t检验和曼-惠特尼U检验 - SD & t-test & Mann-Whitney U test 7分钟学统计 2544 2 ...
火山图是散点图的一种,它将统计测试中的统计显著性量度(如p value)和变化幅度相结合,从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点(基因等)。常应用于转录组研究,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。 所以关注火山图(其它类型图也是),先理解每个点是什么(点代表基因、样品、通...