答：在VMD中，你可以通过以下步骤来合并两个模型：首先，确保两个模型都已加载到VMD中；接着，在Main菜单中选择“Model”选项，然后选择“Merge Models”功能；最后，按照提示选择要合并的模型，并确认合并操作即可。3、如何使用VMD导出data文件？答：在VMD的命令窗口中，输入“topo writelammpsdata XXX.data”命令，...
通过这些命令，可以实现分子的合并，并生成LAMMPS所需的data文件。关键的merge操作通过::TopoTools::mergemols完成。
topo writegmxtop $name\.top topo writelammpsdata $name\.data full 第一步是：加载构型文件 第二...
topo writegmxtop $name\.top topo writelammpsdata $name\.data full 第一步是：加载构型文件 第二...
导出LAMMPSdata格式文件。 在生成石墨烯后,输入如下命令创建模拟盒子 (如果是 GUI 方法,需要先按Enter,会进入vmd >提示符状态): molinfo top set a 96 molinfo top set b 96 molinfo top set c 24 输入以下命令将导出 LAMMPSdata格式文件: topo writelammpsdata graphene.data atomic ...
以下命令直接在VMD的命令行窗口中输入、回车即可实现相关功能 读取、输出LAMMPS的data文件:topo readlammpsdata data.*** topo writelammpsdata data.*** charge 对某类原子进行更改类别、名称或电荷:[atomselec…
VMD中两个模型合并,并导出为lammps的data文件 1 两个模型合并 2 导出data文件 topo writelammpsdata XXX.data
VMD-合并模型与生成data文件 一.data文件的生成 1.XX.data.file 2.选定位置生成data文件,Tk控制台命令如下:topo writelammpsdata XX.data #此生成的data文件不包含键能,键长,键角的信息,需要自己参考文献,手动输入。 #在使用时加入-ignore参数就可以自己输入了。
VMD中两个模型合并，并导出为lammps的data文件 VMD中两个模型合并，并导出为lammps的data⽂件1 两个模型合并
VMD输出lammpsdata文件就不能区分键，键角的类型吗？求指点 我使用topo writelammps date file怎么不...