[Simulations] VMD命令(2): PBC BOX命令黃剛 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 2487 2 07:40 App [Simulations]VMD命令 (3): PBC WRAP命令 6603 0 06:53 App [Simulations]VMD:操作分子/改变位置/转换格式 2218 1 11:35 App [Simulations] VMD命令(1): TCl/Tk终端,命令,数据结构 ...
VMD画球 | 1.调背景颜色(默认黑色,一般调成白色):Graphics-Colors-Display-Background-8white,即可完成2.展示盒子pbc box -color black -width 2 -style dashed。盒子类型见图33.画球。在命令窗口依次输入:draw color red;红色球draw material Opaque;不透明graphics top sphere {x y z} radius r resolution...
我输入pbc box后刷屏 -error Suspicious pbc side length (a=0.000000 b=0.000000 c=0.000000). ...
pbc box pbc wrap -all 复制代码 其中 pbc set {a b c alpha beta gamma} -all 里的 a, b,...
# 在VMD中删除molecule_number为0的文件(第一个导入的文件molecule_number为0)moldelete0建立盒子# 建立立方盒子，并设定x、y、z长度setcell[pbcset{36.04899535.00713240.000}-all]# 显示盒子pbcbox-on# 改变盒子样式pbcbox-center origin-color black-width0.5pbcbox-color black-width0.5# 转换为周期性pbc...
这么做只是设定盒子尺寸为10*10*10，然后你用pbc box才会显示出盒子，但是如果之前有原子在这个盒子范围...
pbc box 复制代码 结果报错…… 说没有设置 pbc 参数 ERROR) Suspicious pbc side length (a=0....
我输入pbc box后刷屏 -error Suspicious pbc side length (a=0.000000 b=0.000000 c=0.000000). ...
pbc box 复制代码 结果报错…… 说没有设置 pbc 参数 ERROR) Suspicious pbc side length (a=0....
如果原子坐标位于盒子坐标范围外的话，你可以使用shiftcenter命令移动盒子至合适的位置例如 pbc box -...