的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口; 点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文; Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。在Linux系统下,可在终端直接输入命令来导入文件,如: vmd complex.pdb 不要忘记点击Load按钮,此时,导入的结构以默认的显示方案显示在显...
的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口; 点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文; Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。在Linux系统下,可在终端直接输入命令来导入文件,如: vmd complex.pdb 不要忘记点击Load按钮,此时,导入的结构以默认的显示方案显示在显...
在VMD主窗口的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口; 点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文; Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。 在Linux系统下,可在终端直接输入命令来导入文件,如: 不要忘记点击Load按钮,此时,导入的结构以默认的显示方案显示在显示窗...
下面我们导入一个蛋白结构,在VMD主窗口的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口; 点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文; Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。 在Linux系统下,可在终端直接输入...
下面我们导入一个蛋白结构,在VMD主窗口的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口;点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文;Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。 在Linux系统下,可在终端直接输入命令来导入文件,如: ...
根据File—Render生成vmdscene.dat和vmdscene.dat.bmp文件，运行render.bat脚本进行图片渲染，生成清晰的....
在Mac OS X中,vmd不会在命令行参数中使用filename打开 、、、 我最近从Linux转到了Mac。我已经在这台新机器上安装了vmd。当我输入以下命令时,vmd加载时没有任何分子:这个*.gro文件包含一个蛋白质分子。我想像在Linux中一样打开这个文件:但它不起作用。通过vmd发射分子是行不通的。我试着用谷歌搜索这个问题,但...
Babel把高斯输出文件转成mol2文件。命令为“obabel -ig98 input_file -omol2 -O output_file”。
从菜单Graphics - Representations更改Drawing Method为Polyhedra，设距离截断为1.1。从菜单File - Render...
在VMD主窗口的菜单栏点击File->New Molecule打开Molecule File Browser窗口; 点击Browse选择要导入的文件,注意目录名、文件名都不应出现中文; Detemine file type可设置文件类型,一般可自动读取。 在Linux系统下,可在终端直接输入命令来导入文件,如: 不要忘记点击Load按钮,此时,导入的结构以默认的显示方案显示在显示窗...