PLS-DA常用于区分各组间代谢轮廓的总体差异,筛选组间的差异代谢物。 正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)结合了正交信号矫正(OSC)和PLS-DA方法,能够将X矩阵信息分解成与Y相关和不相关的两类信息,通过去除不相关的差异来筛选差异变量。 具体流程为:使用SIMCA软件对数据进行对数转换加UV格式化处理,首先对第一主成分进...
代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组 vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combined with network pharmacology reveals a role for astragaloside IV in inhibiting enterovirus 71 replication via PI3K-AKT signaling》...
导读:代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组 vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combined with network ph…
代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组 vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combined with network pharmacology reveals a role for astragaloside IV in inhibiting enterovirus 71 replication via PI3K-AKT signaling》...
导读: 代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Transl...
代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。以展示实验组 vs 对照组的差异代谢物。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combined with network pharmacology reveals a role for astragaloside IV in inhibiting enterovirus 71 replication via PI3K-AKT signaling》...
代谢组学火山图是在常规火山图的基础上,以点的大小表示PLSDA或者OPLSD模型的VIP值。 Journal of Translational Medicine文章《Metabolomics combine…