在分子对接中,通常会使用一种评分函数来评估不同分子之间的结合能力,其中vina score是一种常用的评分函数之一。 vina score是由AutoDock Vina软件提供的评分函数,用于评估分子对接的结合能力。它通过计算分子之间的相互作用能量和结合自由能来得到一个分数,分数越低表示结合能力越强。vina score的计算基于分子的构象和...
1）要拆成单个配体，vina --score_only算对接分数；2）不确定vina的打分能不能反映“A小分子在B小...
权威评分SCORE查看更多评分请选择葡萄酒年份 葡萄酒年份评分者分数评分时间适饮时间 2021 《葡萄酒观察家》 96 -- -- A real head-turner, this detailed and nuanced red opens with notes of Mexican spiced chocolate and crème de cassis before revealing a sleek yet rich core, which is built around pe...
权威评分SCORE查看更多评分请选择葡萄酒年份 葡萄酒年份评分者分数评分时间适饮时间 2009 杰西斯·罗宾逊 15 -- 2013 to 2014 2008 帕克团队 88--2012 - 2017 The 2008 Red Blend is made up of 45% Cabernet Sauvignon, 25% Carmenere, and equal parts of Cabernet Franc and Petit Verdot. It saw 20% ...
权威评分SCORE 关于“vina progreso reserve chardonnay (uruguay)”的评分 酒款年份 评分者 分数 评分时间 2003年 《葡萄酒爱好者》 85 Butterscotch in color and aromas, with apple as the core flavor. Full and interesting, with a long, warm finish. A good deal of zest and attitude. Millions of ...
权威评分SCORE 关于“罗莎酒庄澎马珍藏梅洛红葡萄酒(Vina La Rosa La Palma Reserva Merlot, Cachapoal Valley, Chile)”的评分 酒款年份 评分者 分数 评分时间 2008年 《葡萄酒爱好者》 83 Mild vinegar and full-fledged herbal aromas are typical of traditional Chilean Merlot, and while the palate is...
之后软件会根据输入来计算力场的map并且保证配体和受体都在box中。Vina会根据两者的当前pose计算一个初始能量来作为打分结果,再通过拟牛顿法中的BFGS方法来使得当前pose的能量最小化。这个minimum energy会作为当前pose的最终得分,同时也会作为整个模型的best score的初始化得分。而当前pose也会作为模型的初始pose。
根据这个得分和best score的对比来判断当前pose是否为一个合理的可以接受的pose。如果当前pose的能量值(tmp.e 或者 t.e)小于best score(best.e 或者 b.e)则可以接受,如果tmp.e < best.e,则要根据acceptance probability来计算这个pose被接受的概率。 如果一个pose被认定为可接受pose,则它会作为下一次蒙特卡洛...
然而,一些项与X-score不同,并且在微调打分函数时,我们超越了线性回归。此外,应该注意的是,Vina根据方程(2)或等效的方程(4)对构象进行排名,而X-score只计算分子间贡献。据我们所知,X-score尚未在对接程序中实现,并且忽略内部约束可能会使优化算法找到严重内部冲突的结构。
a我非常担心我的英语考试分数 I worry my English test score extremely [translate] a友谊总是和爱情、亲情相提并论的。 The friendship always with love, the dear ones places on a par.[translate] a我是湖北省作家协会的一员 我是湖北省作家协会的一员[translate] ...