同样地,工作路径下输出一张图片“venn4.png”,打开就是绘制的Venn图。 3.关于交集元素的提取方法 以上自动读取原始数据,并统计各组之间的交集状态,获取共有元素的数量信息后,绘制Venn图,整个过程一气呵成。 但是,如果期望获得各组之间的交集元素具体包含哪些,并将这些交集元素的名称输出出来,应该怎样做呢? VennDi...
library(VennDiagram) 建立工作路径 读取数据 使用函数get.venn.partitions能够获得每部分的信息 ldf$Aolig$ID<-as.character(ldf$Aolig$ID)ldf$Dhapt$ID<-as.character(ldf$Dhapt$ID)ldf$Dsten$ID<-as.character(ldf$Dsten$ID)ldf$Everm$ID<-as.character(ldf$Everm$ID)ldf$Hminn$ID<-as.character(ld...
#韦恩图(VennDiagram 包,适用样本数 2-5)library(VennDiagram)#读入作图文件,all.txt即上述提到的记录group1-4的元素名称的文件dat<-read.table('all.txt',header=TRUE,sep='\t',stringsAsFactors=FALSE,check.names=FALSE)#以2个分组为例#指定统计的分组列,并设置作图颜色、字体样式等venn_list<-list(group1...
VennDiagram包中的函数get.venn.partitions()可以实现这个功能,参考以下示例。工作路径下输出文件“venn4_inter.txt”,可以用Excel打开。group1-4中,TRUE代表该组中出现的元素,FALSE则代表未出现的元素。count为交集元素数量,values为交集元素名称。