R-ggVennDiagram包绘制 R-ggVennDiagram包和ggvenn包一样也是ggplot2的拓展包,其可以支持2~7维的韦恩图绘制,这里小编直接通过使用ggVennDiagram()绘制韦恩图进行解释。 「样例」: 代码语言:javascript 复制 library(ggVennDiagram)# 样例数据 genes<-paste("gene",1:1000,sep="")set.seed(20210419)x<-list(A=sam...
一般来说， 超过 5 个集合的场景，不适合使用韦恩图。R 中 VennDiagram 包的 venn.Diagram()函数、 gplots 包的 venn()函数、 limma 包的 vennDiagram()函数、 venneuler 包的 venneuler()函数都可以绘制韦恩图，但是以 VennDiagram 包的 venn.Diagram()函数绘制的韦恩图效果最佳 加载包构建数据 library(Venn...
一 需要安装和导入的包 代码语言:javascript 复制 install.packages("VennDiagram")library(grid)library(VennDiagram) 二 使用函数及参数 所有参数说明详见https://cran.r-project.org/web/packages/VennDiagram/VennDiagram.pdf, 可以看到参数有很多,不用担心,下文的例子会给出常用的调整参数以及说明。 三 知道各个...
韦恩图(Venn Diagram,也称文氏图),用于可视化元素集合重叠区域的图示。1880年,维恩(Venn)在《论命题和推理的图表化和机械化表现》一文中首次采用固定位置的交叉环形式用封闭曲线(内部区域)表示集合及其关系的图形。其中圈或椭圆重合的部分表示数集间交集的元素,非重叠部分则为特定集合的特有元素。 一、绘制韦恩图的ggVe...
今天先介绍VennDigram包,也是我平常画韦恩图最常用的R包。 先随机生成几个数据集。 set1 <- sample(1:1000,300,replace = F) set2 <- sample(1:1000,130,replace = F) set3 <- sample(1:1000,300,replace = F) set4 <- sample(1:1000,300,replace = F) 2个数据集 library(VennDiagram) ## ...
韦恩图( venn diagram),也叫温氏图、维恩图、范氏图,用于显示元素集合重叠区域的图表。韦恩图是关系型图表,通过图形与图形之间的层叠关系,来表示集合与集合之间的相交关系。每个集合通常以一个圆圈表示。每个集合都是一组具有共同之处的物件或数据。当多个圆圈(集)相互重叠时,称为交集( intersection),里面的数据同时...
1，VennDiagram:VennDiagram包含提供了丰富的功能来绘制Venn图，包括不同形式的Venn图、自定义标签和颜色...
如下图示例,一共包含4个分组,group1-4,下方是各组中所包含的元素名称。各列不等长没关系,某一列内有重复的值也没关系,后续读到R中后能够自动识别并去除空值或重复值。 韦恩图作图文件内容样式 2.R包VennDiagram的韦恩图绘制 接下来,将该文件读到R中,绘制Venn图。
如果我们想在R里面展示的话,需要通过grid.draw操作实现。 p1 <- venn.diagram( x = list(set1, set2, set3), category.names = c("Set 1" , "Set 2 " , "Set 3"), filename = NULL ) # 展示图片: grid.newpage() grid.draw(p1) ...
R语言中有很多程序包(package)可以做这个事情,包括limma, gplots, venneuler, 还有今天我们下面要介绍的VennDiagram包。各个工具用起来差别不是很大,可以根据个人喜好选择,不过其中limma包只能展示最多三个数据集的关系,后面三个包都可以展示超过三个数据集的维恩图。