绘制韦恩图的包有很多,比如gplots包的venn()函数、limma包的vennDiagram()函数、venneuler包的venneuler()函数。 但是这些包绘制出来的图像效果都不是很好,所以我们使用比较成熟的包VennDiagram来绘制韦恩图 安装导入 install.packages("VennDiagram") library(VennDiagram) library(RColorBrewer) 介绍 VennDiagram最多能...
安装VennDiagram包(如果尚未安装)install.packages("VennDiagram")导入VennDiagram包:library(VennDiagram)...
其中Venn能实现2-7个集合的韦恩图绘制,而VennDiagram可以实现2-5个集合的韦恩图,两者都有自己的风格,集合过多就不适合这么做了,羡慕的例子可别适合做转录组多分组比较之后的差异基因集合个数,有想做这种分析的,一定参照这些例子,做出图形非常美观!
1. 安装并加载包VennDiagram > install.packages("VennDiagram") > library(VennDiagram) 2. 画维恩图的函数--venn.diagram() VennDiagram包中画维恩图的函数是venn.diagram(). 下面我们来看一下venn.diagram()函数的使用及参数说明。 > venn.diagram(x, filename, height = 3000, width = 3000, resolution...
使用VennDiagram函数包中的venn.diagram函数绘制三数据集venn图。 安装依赖包: # venn图 install.packages("VennDiagram") library(VennDiagram) 一、模拟输入 产生3个含200字符串的数据集 set1<-paste(rep("word_",200),sample(c(1:1000),200,replace=F),sep="")set2<-paste(rep("word_",200),sample...
在得到数据之后,我们经常会用到维恩图来展示各个数据集之间的重叠关系。本文简单的介绍R语言中的VennDiagram包绘制数据集的维恩图。 一 需要安装和导入的包 代码语言:javascript 复制 install.packages("VennDiagram")library(grid)library(VennDiagram) 二 使用函数及参数 ...
# 安装VennDiagram包install.packages("VennDiagram")# 加载VennDiagram包library(VennDiagram) 1. 2. 3. 4. 5. 步骤二:创建数据集 在画Venn图之前,我们需要创建用于展示重叠和差异的数据集。这里我们假设有三个集合A、B和C。 代码解读 # 创建集合A、B和C的元素setA<-c(1,2,3,4)setB<-c(3,4,5,6)...
1.安装VennDiagram包并加载 install.packages("VennDiagram")library(VennDiagram)2.数据准备 我们准备一个5个集合的data数据 3.初步代码撰写 venn.diagram(x=list(DESeq = data$DESeq,FQ = data$FQ,RPKM=data$RPKM,TC=data$TC,TMM=data$TMM),filename = "Venntest2.tif"),选定画图的数据x,使用x=list(...
步骤1:安装venndiagram包 首先,我们需要在R语言中安装venndiagram包,这能够帮助我们快速地画出venndiagram图表。在RStudio控制台中输入以下代码: install.packages("venndiagram") 这一步将会安装venndiagram包,安装完成后我们可以直接调用该包的包含的函数。 步骤2:准备数据 绘制venndiagram需要有数据。为了方便起见,我们...
install.packages("VennDiagram")library(VennDiagram) 1. 2. 步骤二:绘制Venn图 接下来,我们使用VennDiagram包中的venn.diagram函数来绘制Venn图。以下是一个简单的示例代码: # 创建一个示例数据集set1<-c("A","B","C","D")set2<-c("B","C","D","E")set3<-c("C","D","E","F")# 绘制...