vegan是一个在R语言中用于生态学数据分析的强大软件包,尤其适用于群落生态学和多样性分析。它提供了一系列工具来分析生态数据,广泛应用于生态学、环境科学以及生物保护等多个领域。 vegan包的主要功能 多样性分析:计算Alpha多样性(如Shannon-Wiener指数、Simpson指数等)和Beta多样性(如Bray-Curtis相异度、Jaccard相似度...
All products are made from vegan leather,free of animal-derived ingredients, and are waterproof, mold-resistant, durable, and guaranteed not to peel. CLMのすべての商品は、当社の工房で丁寧に手作りされ、100% 台湾製です。 すべての製品はヴィーガンレザーを使用しており、動物由来の成分を含ま...
一、简介vegan包 vegan是R语言中一个专注于群落生态学的包,它包含了多种计算生物多样性的函数,包括Alpha多样性(如Shannon-Wiener指数、Simpson指数等)和Beta多样性(如Bray-Curtis相异度、Jaccard相似度等)。首先,确保你已经安装了vegan包,如果没有,可以通过以下命令安装: install.packages("vegan") library(vegan) ...
其实就是相当于做partial排序分析。 本文记录一下使用vegan包进行VPA分析的两种方法。 一、 数据准备 # 1. 设置工作路径,老生常谈,设置工作路径和查看路径内容一定是第一步 setwd("D:\\VPAanalysis") getwd() dir() # 2. 调用R包 install.packages("ecodist") library(vegan) browseVignettes("vegan") # ...
使用mermaid语法的journey标签,我们可以创建一个旅行图来展示我们在使用vegan包过程中的探索之旅: 使用vegan包的探索之旅 总结 vegan包是R语言中一个功能强大的生态学分析包,提供了多样性指数计算、物种组成分析、群落相似性分析等功能。通过本文的介绍,希望读者对vegan包有了更深入的了解,并能够在实际研究中应用这些功...
distance-basedredundancyanalysis(db-RDA)是目前在微生物领域应用的最为广泛的环境因子分析,该分析方法内置在R中的vegan包中。相信大家一定都知道vegan包,该R包是进行生态学(包括微生物多样性分析)研究的必备神器!vegan包中提供了所以基本排序分析的方法,可以说是一包在手搞定所有!关于vegan包的详细介绍,请大家查看veg...
R"vegan"包和"RandomForest"包分析土壤环境因子对微生物群落的贡献——基于相关分析和随机森林模型 是一种经典的bagging模型,其弱学习器为决策树模型。为了保证模型的泛化能力,在建立每棵树时,遵循“数据随机”和“特征随机”两个基本原则。其中,数据随机是指从所有数据中有放回地随机抽取数据作为其中一个决策树模型...
网址 http://www.qplot.cn:3838/apps/009-vegan_diversity/ vegan包是一个全面强大的生态学分析包 diversity() 计算多样性 estimateR() 计算丰富度 shannon, 菌群多样性指数 香农-威纳指数的公式是:H=-∑(Pi)(㏑Pi) Pi=样品中属于第i种的个体的比例,如样品总个体数为N,第i种个体数为ni,则Pi=ni/N ...
🌿 追求环保,拒绝动物皮毛,荷兰的小众品牌OMy.Bag为你带来全新选择!这款来自阿姆斯特丹的Vegan系列包包,以苹果皮为材料,手感媲美真皮,保养更简便,刮蹭不留痕。 👜 OMy.Bag的Bio牛皮包包,男女皆宜,设计简约而不失时尚感。近两年,品牌研发出质感类真皮的苹果皮包,自重轻巧,产品不多,但未来将不断推出新款。 🏠...
R包vegan的Mantel tests Mantel tests是确定两组距离测度矩阵(而非两组变量矩阵)之间相关性的相关性测试方法,用于判断一个矩阵中的样本距离与另一矩阵中的样本距离是否相关。Mantel tests零假设为响应变量矩阵中对象之间的距离与解释变量矩阵不存在相关,如果结果中p值显著,则拒绝零假设,即存在相关性,随着一个矩阵中样...