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多线程并行运行Linux效率工具Parallel，bedtools进行窗口划分、窗口GC含量、窗口测序深度和窗口SNP统计，多公共数据库数据下载软件Kingfisher，DNA/RNA/蛋白多序列比对图R包ggmsa，基于ACMG的CNV注释工具ClassifyCNV，基于Symbol和ENTREZID查询基因注释的R包（easyConvert），基于sambamba 窗口reads计数和平均覆盖度统...
利用vcftools进行vcf文件过滤 在GWAS分析之前,一般需要对基因型文件进行过滤,包括:缺失率、MAF、杂合率、双等位、仅SNP等。 运用bcftools进行进行双等位和仅SNP的过滤; bcftools view-m2-M2-v snps input.vcf.gz-Oz-ooutput.vcf.gz--threads20 bcftools支持多线程,速度快; -m2 -M2 指定输出双等位位点; -v snp...
生信软件6 - bcftools查找指定区域的变异位点信息 生信软件7 - 多线程并行运行Linux效率工具Parallel 生信...