vcftools --vcf test.vcf --012 Java脚本也可以实现替换基因型 publicclassHaploType{publicstaticvoidmain(String[]args)throws IOException{this.changeVcfCode("input.txt","output,txt");}publicstaticvoidchangeVcfCode(String input,String output)throws IOException{BufferedReader rd=newBufferedReader(newFileReader...
单倍型 ,是 单倍体 基因型的简称,在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个 基因座 上 等位基因 的组合;通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。 单倍型分析举例:(1) 提取基因X的基因区SNP (2) 重新编码vcf文件的基因型 我们这里主要针对双等位基因vcf文件...
### 基础概念 单倍型(Haplotype)是指在同一条染色体上紧密相连的多个基因座(Locus)上等位基因的组合。这些基因座通常具有较高的连锁不平衡(Linkage Disequilibrium...