[2]、Hennig 组的 VASPsol [3]等。VTST 实现了过渡态搜索的功能,且提供了大量实用的脚本;而 VASPsol 实现了隐式溶剂模型和 Poisson-Boltzmann 模型。这两者都需要加入源码重新编译,如果嫌麻烦的话可以用ASE代替 VTST,但 VASPsol 就没有替代了。 本文基于 Windows 10 v1909 + WSL1 Ubuntu 20.04 LTS + Intel ...
将vaspsol中的复制solvation.F 替换掉vasp544/src中的solvation.F 参考网址 1.https://www.xwang.info...
1.首先到github上下载vaspsol接口源码文件 :https://github.com/henniggroup/VASPsol 2. 解压源码文件并将源码中的补丁文件pbz_patch_610拷贝到vasp6.x.xx/文件夹下。此时不要急着运行官网提供的命令:patch -p0 pbz_patch_610,会报错。作运行后发现补丁文件存在一些小问题需要修改。 具体如下: 分别将补丁文件中...
a. 在使用VASPsol时，设置关键词LSOL = .TRUE. ，默认是相对介电常数为80的水作为隐式溶剂，此处若...
VASPsol++不能做恒电势的静态计算,只有离子步动了,NELECT和电势才会动 不过可以IBRION设置个12或其他无效值,同时给NSW一个可以让电势收敛但又比较小的步数(如20或40等),就能实现原子坐标不更新但NELECT和电势更新的计算了 IBRION = 12 的情况 IBRION = -1 NELECT和电势不会更新 ...
博客:http://blog.wangruixing.cn/, 视频播放量 7617、弹幕量 21、点赞数 474、投硬币枚数 345、收藏人数 144、转发人数 13, 视频作者 啦啦黑还黑, 作者简介 世事如棋,乾坤莫测,笑尽英雄,相关视频:cp2k.inp输入文件初探【CP2K课程02】,超详细电催化台阶图计算步骤,细
Solvation model for the plane wave DFT code VASP http://vaspsol.mse.ufl.edu/ - VASPsol/docs/USAGE.md at master · zhichao-1699/VASPsol
先前本公众号推送了VASP6以上版编译-溶剂化效应报错解决思路,最近VASPsol官方已经发布patch正式支持VASP.6.1.0以上版本。 https://github.com/henniggroup/VASPsol/tree/master/src/patches For VASP versions > 6.1.0 there is currently a patch in /VASPsol/patches/VASPsol6.patch. This patch applies the FERMI...
我找到了VASPsol的安装包，但是具体怎么编译我不知道怎么做！发自小木虫Android客户端
我的理解是首先把VASPsol/src/solvation.F文件拷贝到src/文件夹内即vasp.5.4.X/src/，并且接下来就...