③之后会生成一堆文件,其中有POSCAR-00*和SPOSCAR,分别对应不同的方法密度泛函微扰法(DFPT)以及有限位移法。 ④把原本的单胞POSCAR重命名为POSCAR-unitcell ⑤如果要用密度泛函微扰法计算,需要把SPOSCAR复制成POSCAR, 放入一个新的文件夹中,POSCAR-unitcell也一起放进去,可以把这个文件夹命名为phonon。然后把POTCAR也...
safe_load(stream) phon = data['phonon'] Natom = data['natom'] print('Number of atoms:',Natom) Nkp=len(phon) print('Number of k-points:',Nkp) lines = [] for i in range(Nkp): distance=phon[i]['distance'] band = phon[i]['band'] Nband=len(band) for j in range(Nband)...
VASP计算phonon只有声学支没有光学支VASP计算一个体系的phonon只有声学支没有光学支,请问可能是什么原因?(phonon计算步骤参见帖子:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8503127)回复此楼» 猜你喜欢收调剂生 已经有30人回复 深圳 招生物学、农学专业调剂 已经有12人回复 化学-有机化学316找调剂,一志愿...
画出phonon linewidth 分布图: 1#!/usr/bin/env python23importos4importsys5importnumpy as np6importmatplotlib.pyplot as plt78lw_dir ="linewidth"9freq_file ="m646464.out"10temp = 10#temperature11lw_factor = 10.0#magnified factor1213defreadOutput(file_name):14with open(file_name,'rb') as f...
第一个任务:计算晶体声子谱 自己在小木虫浏览一圈,发现大家用于计算声子谱的工具主要有:vasp+phonon,...
将band.yaml文件导入phononwebsite等在线工具进行可视化分析。可以直观地查看振动模式,以及轻原子和重原子的振动频率特性。通过dos.conf文件,可以生成原子振动频率分布的total_dos和partial_dos图谱。这些步骤共同构成了使用VASP和Phonopy组合计算声子谱的完整流程,为探索材料的热性质提供了有力工具。
如果选择使用DFPT方法,需复制SPOSCAR到一个新的文件夹中,并与POSCAR-unitcell文件一同存放,将文件夹命名为phonon,同时复制POTCAR文件。INCAR文件可采用预先设定的格式。KPOINTS文件应设置为适当的格式,以适应后续计算需求。计算完成后,需准备一个band.conf文件,其中包含原子名称、扩胞倍数、高对称点坐标...
同时在计算声子谱中phonopy所储存的数据文件mesh.yaml和band.yaml文件中也保存了有关群速度的相关信息。 然后我们使用vaspkit的Sort Phonon Band Structure for Phononpy功能处理计算的结果并导出group velocity数据, 在运行过程中我们可以看到软件说明 find group velocity 并写入输出文件中。
理论到实践:VASP+Phono3py计算Phonon Lifetime 在本文中,我们将介绍利用多体微扰理论计算声子寿命与频率的关系。声子寿命可由声子自能的虚部计算,将晶体势能对原子位移做泰勒展开。利用其非谐性的三阶系数(非谐部分的最低阶系数)就可以计算声子自能的虚部。晶体势能哈密顿量的泰勒展开式可以写成:...