各位老师好，最近看到一篇文献中关于vasp的MD轨迹分析，因为是对平衡轨迹（6000帧）的统计分析，不可能...
o 新的快速预测模式(MD 轨迹通常可能快 20-100 倍)。 o 改进邻居列表算法(cell lists + Verlet lists,支持快速预测模式)。 o 新的“超级”标签 ML_MODE,便于训练和应用 ML 力场。 o ML_FF 文件的新人类可读标头包含最重要的参数,ML_LOGFILE 中的相应时间戳。 o 使用优化的默认参数 (ML_IALGO_LINREG =...
把轨迹弄到VMD里后如图操作。这和径向分布函数完全是两码事 老师，我想做的就是MD已经跑了10000步，我想...
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP图中MD 的灰色轨迹图怎么得到的呢?计算之后怎么画出而来的?北京石油化工学院2025年硕士研究生招生接受调剂公告1 1/1 返回列表 查看: 414 | 回复: 0 只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏 在APP中查看 ...
一点小错误:NBLOCK=1指的是多少个离子步(时间步长只是对于MD而言,对于其它的计算,NBLOCK也是起控制作用的)写一次XDATCAR KBLOCK=50NBLOCK*KBLOCK个离子步写一次PCDAT. CONTCAR是每个离子步之后都会写出来的,但是会用新的把老的覆盖CHG是在每10个离子步写一次,不会覆盖CHGCAR是在任务正常结束之后才写的。
你好请问你会做这个图 了吗
o Andersen 恒温器:设置MDALGO =1。还设置ANDERSEN_PROB >0.0 以控制恒温器的随机更新频率。 o Nose-Hoover 恒温器:设置MDALGO =2。还设置SMASS >0.0 以控制与热浴的耦合。 o Langevin 恒温器:设置MDALGO =3。同时设置LANGEVIN_GAMMA >0.0 来控制摩擦参数。如果使用NpT 系综(通过设置ISIF =3),还必须提供晶...
引入快速预测模式，MD 轨迹通常加速 20-100 倍。优化邻居列表算法（cell lists + Verlet lists），支持快速预测模式。引入便于训练和应用 ML 力场的“超级”标签 ML_MODE。ML_FF 文件的人类可读标头包含关键参数，ML_LOGFILE 中显示相应时间戳。使用优化的默认参数 (ML_IALGO_LINREG = 4) 重新拟合的...
POTIM = 3 # time step of MD NWRITE = 0 # controls output NBLOCK = 10 # after ten steps pair correlation function is written out LCHARG = .FALSE. # no charge density written out LWAVE = .FALSE. # no wave function coefficients written out ...
系综设置主要通过MDALGO和ISIF控制,VASP目前支撑的系综有NVT、NPT以及NPH。此外,对于原子间的键长键角,还可以通过输入文件ICONST来控制。最后结果分析的主要文件中,每一步的温度、能量信息在OSZICAR中,XDATCAR为分子动力学计算过程中的轨迹文件。