我打算先用CI-NEB跑一个粗收敛，然后用Dimer精收敛，但是在跑CI-NEB的时候一直没有收敛的趋势，用的...
NEB 是 chain-of-states 搜索方法的一种,经过长时间的发展形成现在的准确性好,稳定性好的 CINEB 方法。做法就是在反应物到产物之间插入一系列结构,共插入 P-1 个,反应物编号为 0,产编号物为 P。不同的是优化不是对每个点孤立地优化,而是优化一个函数,每一步所有点一起运动。 neb 这P+1点保持第一和最后...
如果算出来初/末态存在虚数频率的振动模式,或者NEB过渡态结构存在多个虚数频率的振动模式,可能需要提高计算精度优化相关结构,然后重新计算振动频率。 振动自由能的计算可以参考这篇文章表面吸附分子的振动自由能计算 - 知乎 (zhihu.com) 结束语 NEB计算,收敛是个核心问题,可以参考我的涉及NEB计算的其他博文: CINEB过渡...
2.假如我们可以查看收敛走势了，那么我们发现趋势不好，就应该去调整结构重新计算。vasp的CINEB根据始末...
NEB 是 chain-of-states 搜索方法的一种,经过长时间的发展形成现在的准确性好,稳定性好的 CINEB 方法。做法就是在反应物到产物之间插入一系列结构,共插入 P-1 个,反应物编号为 0,产编号物为 P。不同的是优化不是对每个点孤立地优化,而是优化...
我们将通过VASP进行CI-NEB计算时的初末结构优化来展示dflow的slice功能。通过VASP进行CI-NEB计算时,需要先对initial state和final state进行结构优化,通过dflow可以同时将两个任务并行执行。我们所期待的工作流应该是这样: 同时进行初态结构和末态结构的结构优化 利用VTST中的CINEB功能,进行插点后搜索过渡态结构 初末...
过渡态计算VTST插件下载与安装,NEB与CINEB算法 | DFT计算特训营【朱老师讲VASP】 3586 0 05:26 App 从0开始学习vasp番外 手把手教你如何编译 VTST插件到VASP 235 0 01:21:25 App CP2K简介(6/7)-元动力学,NEB方法 3508 0 13:37 App 过渡态计算势能面、鞍点、反应路径 | DFT计算特训营【朱老师讲VASP...
1:先检查初末态结构是否为势能面连续的两个极小值点,如果不是,新增加结构优化计算,找到中间的谷点(可以利用CINEB中间的那种比初末态能量都低的点)。当已经完成了粗收敛计算或者说精收敛计算失败后,如果回过来发现初末态不连续时,不要来不来就重来,先看下粗收敛、精收敛过程中有没有可以用improved dimer method...
利用VASP,通过CINEB方法计算过渡态,一个循环后提示错误forrtl:severe(24):end-of-fileduringread,unit73,file/home/hhc/Ti-M/DISPLACECAR,如图所示,是否是VASP的编译存在问题?图片2018.png 第一性原理 Vasp&MedeA
如题 我使用vasp计算cineb中断了 于是我将INCAR中的ISTART改为1 ICHARG改为1 之前的计算输出了WAVECAR...