1:先检查初末态结构是否为势能面连续的两个极小值点,如果不是,新增加结构优化计算,找到中间的谷点(可以利用CINEB中间的那种比初末态能量都低的点)。当已经完成了粗收敛计算或者说精收敛计算失败后,如果回过来发现初末态不连续时,不要来不来就重来,先看下粗收敛、精收敛过程中有没有可以用improved dimer method...
pl生成的，但我要是CINEB做的粗收敛，后复制了一个CONTCAR过去，和之前生成MODECAR不是一个结构生成的...
1.你的EDIFF和EDIFFG精度都不在一个水平，你的电子步很容易收敛。而离子步很难收敛，这样可能导致不...
pl生成的，但我要是CINEB做的粗收敛，后复制了一个CONTCAR过去，和之前生成MODECAR不是一个结构生成的...
1. 那个气体小分子太靠上了，很难说向上一个周期对当前模型是不是有相互作用，可以扩胞计算一下单点...
NEB 是 chain-of-states 搜索方法的一种,经过长时间的发展形成现在的准确性好,稳定性好的 CINEB 方法。做法就是在反应物到产物之间插入一系列结构,共插入 P-1 个,反应物编号为 0,产编号物为 P。不同的是优化不是对每个点孤立地优化,而是优化一个函数,每一步所有点一起运动。
NEB 是 chain-of-states 搜索方法的一种,经过长时间的发展形成现在的准确性好,稳定性好的 CINEB 方法。做法就是在反应物到产物之间插入一系列结构,共插入 P-1 个,反应物编号为 0,产编号物为 P。不同的是优化不是对每个点孤立地优化,而是优化...
振动自由能的计算可以参考这篇文章表面吸附分子的振动自由能计算 - 知乎 (zhihu.com) 结束语 NEB计算,收敛是个核心问题,可以参考我的涉及NEB计算的其他博文: CINEB过渡态初始结构的生成 NEB计算过渡态(VASP vs VTST) 招聘 课题组长期提供科研助理和博士后等科研职位,欢迎从事材料计算和机器学习相关研究的同学加入!
41、 CINEB vasp自带的NEB也可以,但是镜像受力 优化和势垒精确度以及收敛速度略逊于 CINEB,lz 可以 google 到其官方网站了解。初始和 终了的结构是局部能量最低的构型( vasp 做弛豫收敛的构型) ,至于 lz 所关心的是从具体 结构之间的过渡的化,一是猜测,二是文献吧。基本出发点是能量趋向降低的构型。2 关于结构...
结构优化、过渡态计算不收敛的解决方案 包含:用CINEB粗收敛+Dimer/CINEB精收敛的参数和命令(一点经验:CINEB粗收敛+Dimer精收敛相比直接CINEB一步寻找过渡态更快) free energy profile绘制 可视化振动 使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)bbs.ke...