phonopy --fc vasprun.xml phonopy --dim='5 5 1' -c POSCAR-unitcell band.conf phonopy-bandplot --gnuplot>551.dat 就可以获得二阶力常数矩阵 FORCE_CONSTANTS 和声子谱的数据 551.dat . ⑤如果是使用有限位移法,从④直接接到这一步。 这里需要准备和 P
phonopy --f vasprun.xml 5. 获取声子谱 所需文件band.conf TOM_NAME = Ni DIM = 2 2 2 PRIMITIVE_AXIS = 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 BAND = 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.5 0.5 FORCE_CONSTANTS = READ phonopy --dim="2 2 2" -c POSCAR-unitcell ...
1. 克隆并启动容器 登录OpenBayes.com,在「公共教程」页面,选择「VASP 结合 phonopy 计算硅的声子谱」教程。 页面跳转后,点击右上角「克隆」,将该教程克隆至自己的容器中。 选择「NVIDIA GeForce RTX 4090」以及「vasp」镜像,OpenBayes 平台提供了 4 种计费方式,大家可以按照需求选择「按量付费」或「包日/周/月...
vasp计算声子谱主要有两种方法:线性响应法和有限位移法。线性响应法技术上比较方便,但对于复杂结构,计算时间可能会很长。有限位移法虽然操作稍麻烦,但代码层面简单,设计合理可以极大提高计算效率。具体计算步骤包括结构弛豫、生成有限位移后的结构文件、进行VASP计算以获得力常数信息,最后通过后处理得到声子谱。
在vasp中提交计算任务。完成计算后，使用phonopy计算force-constants：phonopy --fc vasprun.xml 随后，获取声子谱所需的文件：band.conf。使用以下命令计算并绘制声子谱：phonopy --dim="2 2 2" -c POSCAR-unitcell band.conf 命令后面添加 -p band.conf 进行band plot，得到PDF文件保存声子谱。接着...
我的经验是，可以调节 IBRION 这个参数吧。搬运自https://www.vasp.at/wiki/index.php/IBRION：For ...
VASP phonopy 方法/步骤 1 声子谱是一个重要参数，可以鉴定和预测体系是否稳定存在 2 安装phonopy，这里小编就不具体讲了，不会的小伙伴等小编以后补上相关软件的安装就可以了，安装好以后会出现如下界面 3 建立好POSCAR后，第一步就是做超胞：如下图，这个是小编的原胞 4 计算声子谱需要建立超胞，那么可以使用...
phonopy-bandplot --gnuplot>PBAND.dat 来将数据存放到PBAND.dat文件中,进行后续处理。 TIPS:关于虚频,使用上述方法得到的声子谱常常在gamma点附近有虚频,解决方法我知道的一是尽可能的再去优化原胞结构,二是尝试使用更大的超包进行计算,当然那样运算量会更大。 新手一个,仅供参考。
若遇到生成FORCE_CONSTANTS文件困难，则需去掉注释部分。将每个计算目录job-*中的vasprun.xml文件复制到上级目录，改名并编号。接着，执行三条命令以获取二阶力常数矩阵FORCE_CONSTANTS和声子谱数据551.dat。声子谱数据551.dat可以导入OriginLab软件绘制，FORCE_CONSTANTS文件则可用于进一步计算晶格热导率。