3.5 扩展自旋导致的电子结构相变对COHP影响的认知 3.6 这个我没看懂,就不翻译了,哈哈哈 4. COHP计算流程 4.1 VASP结构优化 4.2 COHP计算 4.3 前面算完了,就要准备输入文件lobsterin了 4.4 输入结果分析 最近在做一些高压结构预测的工作,获得了一些新结构,但是想要分析一下他们的成键方式,发现自己除了ELF可以分析...
bash cohpbetween atom 1 and atom 2或者,如果你想要计算所有键长大于1.4小于1.8的键:bash cohpGenerator from 1.4 to 1.8 type N type O这里,我们定义了键长的范围,并指定了N和O原子。 结果解读 📈最后,我们可以通过VASP的计算结果来分析成键强度。通常会得到DOS(Density of States)和-COHP(Charge Overlap ...
3. 在Lobsterin文件中，设置COHPstartEnergy和COHPendEnergy参数来定义能量范围。这两个参数定义能量范围...
_sv后缀的；换个小点儿结构（能行）：③静态自洽分析波函数大小约为1G的，能正常输出COHP.lobster!
Lobster目前最流行的COHP计算程序就是Lobster。 具体计算步骤 Lobster安装首先在官网下载Lobster软件。Lobster无需安装,加压即可用。为了之后方便使用,建议将Lobster拷贝到~/bin文件夹中,方便调用。 VASP计算使用VASP默认版本,不要用Gamma版本。使用PAW赝势。做静态计算,此静态计算和普通的有所区别:NSW=0ISIF=0ISYM=0或...
图4b显示了H-1s和O- 2p轨道的态密度(DOS)和COHP。COHP用于计算电子状态重叠对成键或反键轨道的贡献。图4b显示了H−O的s−p轨道杂化和负iCOHP(−0.55 eV),证明了长程氢键相互作用。氢键促进机制稳定了Fe位上的OH中间体,从而拓宽了FeOHN4PO活性结构的范围。
图4b显示了H-1s和O- 2p轨道的态密度(DOS)和COHP。COHP用于计算电子状态重叠对成键或反键轨道的贡献。图4b显示了H−O的s−p轨道杂化和负iCOHP(−0.55 eV),证明了长程氢键相互作用。氢键促进机制稳定了Fe位上的OH中间体,从而拓宽了FeOHN4PO活性结构的范围。
🔍 功能亮点: 一键批量提交优化、静态计算、DOS、COHP等常见任务。 支持集群原子替换、能量计算和ZPE零点能查看。 便捷的文件和文件夹批量删除,优化计算流程。 自动生成机器学习分析所需的可视化结果,如热图、散点图等。 支持多种机器学习模型,包括支持向量机、随机森林等。
首先，让我们了解一下COHP（Crystal Orbital Hamilton Populations）和COOP（Crystal orbital overlap population）。COHP通过分析晶体轨道之间的哈密顿矩阵元素，提供了一种计算电子结构中键合信息的手段，而COOP则是通过晶体轨道重叠电子密度加权态密度来构建键合指标。接下来，本文回顾了Lobster软件的发展历程。L...
COHP处理平面波基组波函数 最初的COHP只能处理以原子为中心基函数的波函数，流行方法是linear muffin-...