US-align高度优化的C++代码使其在比其它在特定的结构比对任务上优化的程序的速度提高了数倍,并有更准确的结构比对结果。其中,蛋白与核酸的单链比对基本上分别沿用TM-align与RNA-align算法,多重比对借鉴mTM-align算法并新增RNA多重比对功能,而复合物结构比对算法则是完全从头开发,在准确性和速度上都超越旧版的MM-ali...
其中,蛋白与核酸的单链比对基本上分别沿用TM-align与RNA-align算法,多重比对借鉴mTM-align算法并新增RNA多重比对功能,而复合物结构比对算法则是完全从头开发,在准确性和速度上都超越旧版的MM-align(图2)。 图1. US-align所包含的结构比对功能。a, 单链结构的两两比对。b, 复合物结构的两两比对。c, 多重...
US-align提供了四种对齐的模式:①单体结构对齐模式,能在残基层面对两个单链进行对齐;②寡聚体对齐模式,能在链及残基两个层面对齐两个以上链的寡聚体的结构;③多结构对齐模式,能同时对齐三个以上的单体结构;④基于模板的对接模式,能将两个及以上的...
US-align是第一款同时提供蛋白、RNA、DNA的单体及其复合物的两两比对以及多重比对的程序(图1),并且所有比对功能都统一使用的TM-score作为打分函数。US-align高度优化的C++代码使其在比其它在特定的结构比对任务上优化的程序的速度提高了...
US-align是第一款同时提供蛋白、RNA、DNA的单体及其复合物的两两比对以及多重比对的程序(图1),并且所有比对功能都统一使用的TM-score作为打分函数。US-align高度优化的C++代码使其在比其它在特定的结构比对任务上优化的程序的速度提高了数倍,并有更准确的结构比对结果。其中,蛋白与核酸的单链比对基本上分别沿用TM-...
Cancel Submit feedback Saved searches Use saved searches to filter your results more quickly Cancel Create saved search Sign in Sign up Reseting focus {{ message }} pylelab / USalign Public Notifications You must be signed in to change notification settings Fork 24 Star 125 ...
2 Nature Methods 首个多功能的结构比对程序--US-align 21 2022-09 3 对比学习能够快速映射到数百万规模的多模态单细胞图谱 38 2022-09 4 肿瘤起源分类的发展反褶积 42 2022-09 5 多模式整合预测非小细胞肺癌患者对PD-(L)1疗法的反应 19 2022-09 ...
Metrics Abstract Structure comparison and alignment are of fundamental importance in structural biology studies. We developed the first universal platform, US-align, to uniformly align monomer and complex structures of different macromolecules—proteins, RNAs and DNAs. The pipeline is built on a uniform...
TMalign.cpp -do Jul 6, 2024 TMalign.h -chimerax unaligned chain Nov 9, 2024 TMscore.cpp -model1 -model2 Apr 2, 2024 TMscore.h two proteins => two structures Apr 8, 2022 USalign.cpp log Nov 9, 2024 __init__.py usalign_msta in pymol ...
Our client centric approach and passion for driving IT innovation has enabled us to provide tailored solutions and business transformations for over 35 years. Leading firms have relied on Align to provide forward-thinking technology strategies that support their current and future business needs. ...