对于表格型文本数据(tsv,csv等),这里介绍两个命令,分别是提取特定列的命令cut与命令行中的可视化命令column。 cut cut用于提取有固定分隔的列,例如我们提取bed文件的第一列(染色体位置): $ cut-f1Mus_musculus.GRCm38.75_chr1.bed|head-n3111 提取多列采用-f1-8(提取第1到第8列)或者-f1,5,8(提取第1,5,...
这个机制称为"Brace Expansion",再举个例子:"diff .bashrc{,.backup}",显示.bashrc和.bashrc.backup两个文件之间的差异。 column:也有人提过,放在这里算总结吧,一个常用的语法是'mount | column -t',或者 'df | column -t',让输出更加容易阅读。 ssh/sshfs/scp:善用ssh相关工具让你的远程工作起来更加方便...
CTRL+R: 这个也很常用，搜索命令历史相当方便。grep/sed/cut/tr/: 这几个命令的组合能够很方便的解析...
这个机制称为"Brace Expansion",再举个例子:"diff .bashrc{,.backup}",显示.bashrc和.bashrc.backup两个文件之间的差异。 column:也有人提过,放在这里算总结吧,一个常用的语法是'mount | column -t',或者 'df | column -t',让输出更加容易阅读。 ssh/sshfs/scp:善用ssh相关工具让你的远程工作起来更加方便...
env: 运行一个命令,在脚本中非常有用 look: 查找以字符串开头英文单词 cut and paste and join: 数据操作命令 fmt: 格式化一个文本段 pr: 以页/列为单位格式化一串文本或一个较大文件 fold: 使文本换行 column: 格式化文本成列或表格 expand and unexpand: 在制表符和空格之间转换 ...
cuts supports multi-file & multi-column mixes For example 2nd column from file1 and 3rd column from file2. Obviously with the power of the bash shell you can do stuff like: $ paste <(cut -d, -f1 file.csv) <(cut -d"<TAB>" -f2 file.tsv) but that requires too much typing (3...
A. cut B. paste C. join D. sort 答案:A 46.在Unix中,用于对文本进行排序的命令是? A. sort B. uniq C. wc D. tr 答案:A 47.要统计文本的行数、单词数和字符数,使用以下哪个命令? A. wc B. count C. stat D. size 答案:A 48.以下哪个命令用于去除文本中的重复行? A. sort -u B. un...
一、UNIX命令格式 1、UNIX命令提示符 在命令行下，操作系统会显示一提示符，提示用户在此提示符...
#!/bin/bash # 定义额外列的值 extra_column="Extra" # 输出表头 echo "Original Column, $extra_column" # 读取输入文件的每一行数据 while read line do # 获取原始列的值 original_column=$(echo $line | cut -d ',' -f 1) # 计算额外列的值 extra_column_value=$(echo $original_column | ...
学习了cat, head, tail, less, more,cut,sort,wc,uniq等基本命令后,如何使用这些命令对生物信息数据做简单的分析呢。大致可以完成以下任务: 了解数据内容 数据基本信息,例如文件大小,有多少行 数据提取,排序和去重 所以本文假定你掌握了基本的Unix命令,对于不知道的命令会用man或者help去了解这些命令的作用。