sp:Swiss-Prot数据库简称 Q12888:UniProt ID号 TP53B_HUMAN:UniProt登录名 TP53-binding protein 1:蛋白质名称 OS=Homo sapiens:Organism简称,表示人类蛋白质 OX=9606:Organism Taxonomy,物种分类数据库Taxonomy ID GN=TP53BP1:Gene name,基因名为TP53BP1 PE=1:Protein Existence,蛋白质可靠性,数字越小越可靠: ...
1、进入官网:https://www.uniprot.org/ 1、切换数据库,也就是上面介绍的 2、输入基因名,uniprot id,物种名等都可以 3、点击进行搜索 4、进入搜索结果页面 https://www.uniprot.org/uniprotkb?query=oct4 新版界面主要由,搜索框,搜索结果表,和左边过滤选项面板构成 5、过滤选项面板 来源库:Reviewed:存储在Swiss...
进入官网(https://www.uniprot.org/),可以看到数据库页面分为上下两部分,上半部分为搜索框(图1),下半部分则是数据库和分析工具,也是本期主要介绍的内容。一、UniProt数据库构成 目前,UniProt主要由以下子库构成:1. UniProt Knowledgebase(UniProtKB)该数据库由Swiss-Prot和TrEMBL两个数据库构成。Swiss-P...
相似蛋白 该版块提供了与目的蛋白质序列相似的蛋白质的链接。目的蛋白详情界面共11个版块,几乎所有版块内容都有相关的数据库链接可获得更加详细的信息,这里就不一一截图展示了。以上就是UniProt数据库使用方法的全部介绍,希望对各位小伙伴有所帮助。下期将介绍UCSC数据库的使用方法,感兴趣的小伙伴可以留意一下哦~
1.1 Uniprot UniProt(Universal Protein Resource,https://www.uniprot.org/)是一个免费开放的综合性蛋白质数据库。该数据库蛋白信息来源于EMBL、GenBank、DDBJ等公共数据库(非冗余蛋白质序列数据库),目前使用频率非常高,包含信息非常全面。该数据库主要提供了蛋白质序列和丰富的功能注释信息,用途多样,是查询蛋白功能和...
首先打开官网主页:www.uniprot.org/,搜索栏输入IL-6,点击Search或键盘回车,然后左侧栏选择Human Entry:Uniprot给每个蛋白质赋予的ID(由此进入查看具体信息) Entry name:蛋白ID的简要名字 Protein names:蛋白质的名字 Gene names:编码这个蛋白的Gene名字 Organism:蛋白质的种属来源 ...
登陆uniprot官方网站(http://www.uniprot.org/,见截图)即可看到,目前uniprot网站收录的sp数据库有554241条蛋白条目,tr数据库有84827567条。当然这一数据每天都有更新。更多数据库参考信息相关链接:http://www.uniprot.org/help/uniprotkb 本期学习先到这里,下期继续~...
在Uniprot中搜索PD-1蛋白 打开数据库并进行搜索 为了获取PD-1蛋白的注释信息,研究者可以通过网站www.uniprot.org进行搜索。只需在UniprotKB界面的检索框中输入“programmed cell death protein 1”,并点击“Search”,即可获取结果列表。搜索结果将为您呈现不同物种PD-1的蛋白信息,包括人类和鼠类PD-1的数据。进入...
UniProt简介 目前较常用的蛋白组数据库是UniProt和NCBI这2个公共库,其中UniProt整合了Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三个数据库,主要优势在于添加了蛋白功能注释信息。具有更新速度快、与其他数据库联系密切、分析工具齐全、使用便捷的特点,成为了目前信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。