从实验结果可以看到，Uni-Docking Fast模式计算速度快，对接每个配体的平均时间最低仅为0.10s，且保持了良好的阳性分子富集能力，非常适合于特大型数据库的虚拟筛选。Uni-Docking Detailed模式计算精度高，无论在阳性分子富集能力或是结合构象预测上都具有良好的表现。而Uni-Docking Balanced模式在速度和精度上表现较为平均...
2023年6月13日,深势科技在Journal of Chemical Theory and Computation上发表封面文章Uni-Dock: GPU-Accelerated Docking Enables Ultralarge Virtual Screening[4],发布了基于GPU加速的高性能分子对接引擎Uni-Dock,在保持原始计算精度的前提下,在NVIDIA V100 GPU上实现了分子对接计算速度对比单核CPU超过1600倍的加速比。...
Hermite®新版本的上线,吸引了众多药物研发工作者和创新型药企的关注。为向广大用户和行业伙伴提供从研发需求到售后服务的一站式体验,深势科技策划组织了Hermite®体验日系列活动。本视频将为您介绍GPU极致加速的分子对接引擎Uni-Docking:👉🏻提供Fast、Balanced
分子对接与 Uni-Dock 分子对接(Docking)方法在药物早期设计阶段的虚拟筛选中具有重要应用,但是随着化学分子库的急速增长,传统的分子对接已经难以在合理成本下处理千万级、亿级数据库的虚拟筛选工作[1]。 2023年6月13日,Uni-Dock: GPU-Accelerated Docking Enables Ultralarge Virtual Screening[2]作为封面文章在 Journal...
近日,在先后推出Uni-Fold、Uni-FEP、Uni-EM 、Uni-Mol等“Uni-”系列产品后,深势科技继续“追风逐月”,发布GPU极致加速版分子对接引擎Uni-Docking,在NVIDIA V100 GPU上实现了相比单CPU核心超1000倍的加速。研发团队使用Uni-Docking以KRAS ...
近日,在先后推出Uni-Fold、Uni-FEP、Uni-EM 、Uni-Mol等“Uni-”系列产品后,深势科技继续“追风逐月”,发布GPU极致加速版分子对接引擎Uni-Docking,在NVIDIA V100 GPU上实现了相比单CPU核心超1000倍的加速。研发团队使用Uni-Docking以KRAS G12D为测试靶点,对Enamine Diverse Real类药数据库3820万分子开展了分层高通...
实现了单配体单分子对接计算模式:在原有的单配体多分子的计算流程基础上,使用 CUDA stream 轻量化地实现 1:1 docking 的快速计算,并提供了相关计算案例与配置文件结构。 在基准测试机型上,Uni-Dock v1.1 的单分子对接速度分别是 fast 模式下 2...
分子对接(Docking),通过计算模拟对候选分子与目标靶点的结合亲和力进行快速评估的一种方法,由于具有通量大、速度快、富集能力好的特点,被广泛应用于药物设计的早期阶段虚拟筛选中,用来在大规模分子库中寻找潜在的活性分子[1]。然而,随着化学分子库的急剧扩大,传统的分子对接已经难以在合理成本下处理千万级、亿级数据库的...
近日,在先后推出Uni-Fold、Uni-FEP、Uni-EM 、Uni-Mol等“Uni-”系列产品后,深势科技继续“追风逐月”,发布GPU极致加速版分子对接引擎Uni-Docking,在NVIDIA V100 GPU上实现了相比单CPU核心超1000倍的加速。研发团队使用Uni-Docking以KRAS G12D为测试靶点,对Enamine Diverse Real类药数据库3820万分子开展了分层高通...
分子对接（Docking）方法在药物早期设计阶段的虚拟筛选中具有重要应用，但是随着化学分子库的急速增长，传统...