我自己觉得,我们复现后的降维聚类分群结果,理论上比文章的好看一点,这就是我先表达的结论:umap的单细胞可视化效果比tSNE好 不知道你是否认同呢? 学徒作业 从我们上面的简单的降维聚类分群来块,我们所命名的成纤维和内皮其实仍然是异质性比较大的群,比如上面的成纤维里面肯定是有周细胞和平滑肌细胞,需要细分。另外内...
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umap的单细胞可视化效果比tSNE好 昨晚有幸听了上海长海医院任善成教授的关于前列腺癌的精准诊疗的演讲,任教授提到了他们2021年1月在在 Nature Cell Biology 杂志发表了题为《Single-cell analysis reveals transcriptomic remodellings in distinct cell types that contribute to human prostate cancer progression》论文. ...