umap里也一样，此时坐标的具体值没有现实意义，也不代表什么。只代表样本点在低维空间的相对位置关系。...
umap+facet_zoom(xlim=c(-15,-10),ylim=c(0,2.5)) 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 umap+geom_mark_rect(aes(label=RNA_snn_res.2),show.legend=FALSE)+theme_void()
UMAP图的横纵坐标并不直接代表任何具体的物理量或测量值，而是样本在降维后的高维结构中相对位置的抽象表示。具体来说：横坐标：在UMAP图中，横坐标是降维后二维空间中的一个维度，它反映了样本在特定维度上的相对位置。这个位置是基于原始高维数据中样本间的相似性和差异性计算得出的。横坐标的值并不具...
比如，UMAP中的坐标就像是一个艺术作品中的坐标，小狗、女士和小孩的坐标值虽然具体，但并不直接反映现实距离，而是反映他们在低维空间中的位置关系，就像地球上的经度和纬度，虽然具体值变化，但地理位置不变。总结来说，UMAP图的横纵坐标并不直接反映物理世界，而是样本在降维后的高维结构中相对位置的抽...
然后我看官网最后一条要求:需要有python环境的umap,于是在R中创建了python脚本,运行了上面那一步,失败! 经过和python反复斗争许久之后,发现了问题的所在(敲黑板,划重点)。(见图3)NMF需要更新。但是无论用什么代码下都不是最新版本,怎么办呢? 点击R Studio中 tools-check for package Updates,找到NMF更新。
先跟大家讲讲这小人图标到底是干啥的。 其实它属于手机无障碍功能的快捷进入途径;主要作用是为了视力不佳或是行动不便的人群给予便利。比如说只需一键就能调节音量,能够迅速地开启应用,还可以朗读屏幕上的内容等等,这就如同一个极为贴心的小助手一般。 不过于我们一般的用户而言,它有时仿若一个“淘气包”,毫无缘由...
umap +geom_voronoi_tile(aes(fill = RNA_snn_res.2, group = -1L)) + geom_voronoi_segment() Voronoi图背后的想法是将图的区域分割成尽可能多的部分。与网格或热图不同,Voronoi根据与其他点的接近程度为每个点绘制自定义形状。它返回一个看起来像彩色玻璃的图。这可以很好地确定每个区域内的最近点。例如,...
揭示UMAP坐标背后的奥秘在探索生物组学数据特别是转录组表达矩阵的世界里，理解UMAP图的横纵坐标至关重要。这个二维空间就像一个魔法图腾，能揭示样本间的复杂关系。想象一下，我们面对的是一个(features, genes)为行，samples, cells为列的矩阵，每个样本点是一张个性化的基因表达地图。要揭示样本之间的...
umap+geom_voronoi_tile(aes(fill=RNA_snn_res.2,group=-1L))+geom_voronoi_segment() Voronoi图背后的想法是将图的区域分割成尽可能多的部分。与网格或热图不同,Voronoi根据与其他点的接近程度为每个点绘制自定义形状。它返回一个看起来像彩色玻璃的图。这可以很好地确定每个区域内的最近点。例如,零售商可以使...