(3)维度嵌入:UMAP在低维空间中对点进行重排,使得低维空间的距离大致对应原数据中的相似性。
12种常见生信图解汇总,一次讲清! 文献中的这些数据图要怎么看呢?一起跟着上图来学习下吧~ 免yi荧光图细胞凋亡流式图 UMAP图免yi组化图 GSEA富集图 Co-IP图生存曲线 PCA图箱线图火山图热图 VROC曲线蕞后 - 生信sci文章指导于20241121发布在抖音,已经收获了7987个
然后我看官网最后一条要求:需要有python环境的umap,于是在R中创建了python脚本,运行了上面那一步,失败! 经过和python反复斗争许久之后,发现了问题的所在(敲黑板,划重点)。(见图3)NMF需要更新。但是无论用什么代码下都不是最新版本,怎么办呢? 点击R Studio中 tools-check for package Updates,找到NMF更新。
(3)维度嵌入:UMAP在低维空间中对点进行重排,使得低维空间的距离大致对应原数据中的相似性。