如果你的UK Biobank项目申请Proposal已经成功获批,那么接下来就进入到了数据下载和使用阶段。UKB目前与AMS和DNAnexus合作,建立了云计算平台Research Analysis Platform(简称RAP,地址:ukbiobank.dnanexus.com/),所有项目申请获批的研究人员都可以直接使用!本次推送介绍如何在RAP系统中创建项目并下载所需变量。 【注意】RAP...
由于2024年7月UKB关闭了Bulk数据下载权限(详见【UKB快讯】UK Biobank数据今后只可通过RAP云端平台获取 zhuanlan.zhihu.com/p/70),影像数据今后只可以通过RAP在线工具获取了。有需要的可参考RAP/DNAnexus官方账号教程:youtube.com/watch? --- 手动分割线 --- 以下是2023年的原文章: 截至目前,英国生物银行(UK Biob...
variants.tsv.bgz这个文件就在Manifest 201807的第11行,找到下载链接直接下载即可: 下载好之后我们把它读取进来: variants_anno <- vroom::vroom("./ukbiobank/variants.tsv.bgz") dim(variants_anno) ## [1] 13791467 25 发现这个数据和fat_bothsex这个数据的行数是一样的。其实在README的描述中人家就说的很...
669 -- 13:04 App UKBiobank-RAP云RStudio中下载或直接读取工程中的数据 316 -- 3:21 App 3分钟带你认识-PRS多基因评分Polygenic Risk Score 303 -- 2:35 App UKBiobank-RAP-FastUKB可视化工具简介 323 -- 9:03 App UKBiobank-RAP常用直连指令--必备讲解 3332 1 4:02 App Nature首发的UKB的免...
英国生物银行（UK Biobank）已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform（RAP）系统直接下载原始影像数据的方法，适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。注意：UKB影像...
访问ukbiobank.dnanexus.com/...网址，创建新账户，并将UKB中的AMS账号关联起来。登录RAP系统 使用账户进行登录。建立项目 在RAP系统中，点击PROJECTS选项卡，选择右上角的+ New Project按钮。填写项目名称（如使用"demo1"），申请ID、账单信息等信息，然后点击Create Project创建项目。在创建项目后，系统...
在使用UKBiobank数据时,有些数据是可以下载的,而有些数据则不能下载。以下是详细的说明: 不能下载的数据: Bulk内的所有数据 通过app开头的数据库链接文件提取的数据(如table-exporter或数据库接口提取的临床表型数据) 可以下载的数据: 通过原始数据分析得到的摘要级数据,例如cox回归结果和基线表统计结果 对统计结果进...
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...
UK biobank中GWAS数据下载链接An**us 上传6.14MB 文件格式 xlsx excel UK biobank中GWAS数据下载链接 点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载 2.31二分法求根.cpp 2024-12-29 19:02:58 积分:1 java中while循环.md 2024-12-29 18:25:37 积分:1 java二叉树的遍历.md 2024-12-29 18:17...
UK Biobank(英国生物样本数据库),简称为UKB,UKB生物数据库是由维康信托基金和英国政府(医学研究委员会、卫生部和苏格兰行政院)资助,并注册成为一家慈善公司。该生物数据库是一个试点项目,目的是将英国电子医疗记录中的数据与遗传数据联系起来,从而建立一个更全的英...