UALCAN数据库提供了TCGA的基因转录组数据,允许用户识别生物标记物,评估基因在不同分子亚型中的表达,评估启动子甲基化对基因表达的表观遗传调控,并与基因表达的相关性,提供描述基因表达的图表和基于基因表达的患者生存信息等功能。UALCAN可以帮助我们识别新的诊断和治疗靶点,研究任何特定癌症的基因表达及其疾病相关性。凭借其直观的特性,UALCAN将使跨学科的研究人员能够方...
UALCAN：（http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的、用户友好的、交互式的web资源，用于分析癌症组学数据。UALCAN的设计目的是：提供对公开的癌症组学数据TCGA的方便访问允许用户识别生物标记物或对潜在的感兴趣基因进行电子验证提供基于基因表达的描述基因表达和患者生存信息的图表通过启动子甲基化评估基因...
Day10.UALCAN使用教程 1.观看UALCAN数据库使用的视频。链接见学习群。2.实战复现。根据ULACAN数据库PPT演示的方法,复现生信论文28 中Figure2B和C(生信分析28.病毒感染或入侵表型);任何问题,请及时群内讨论。 基因差异表达和生存分析,严格意义上讲均属于表型。免疫浸润分析属于交叉,算是表型式的解释,就是用现象解释...
通过UALCAN数据库的分期分析功能,研究人员可以获得关于癌症在不同分期下的基因表达、蛋白质表达和生存率等多方面的信息。 四、分期分析的具体步骤 分期分析的具体步骤包括选择特定的癌症类型、指定分期标准、利用UALCAN数据库的相关工具和功能进行数据提取和分析。首先,研究人员需要登录UALCAN数据库并选择感兴趣的癌症类型。
我们可以利用UALCAN数据库进行miRNA的差异分析,生存分析,以及靶基因预测 miRNA表达分析 每一种差异分析都可以根据临床信息进行分组 miRNA生存分析 miRNA靶基因预测 可见靶基因预测是根据图中的三个数据库进行预测的。这里还提供了靶基因的差异表达情况,非常贴心 TCGA mRNA分析 热图 我们可以看一下输入基因的热图热图 也可...
UALCAN数据库(ualcan.path.uab.edu/ind) 是一个全面的,用户友好的,交互式的网络资源分析癌症组学数据。它有以下几大好处: 1)可以使用UALCAN数据库方便地访问公开癌症组学数据(TCGA、MET500 CPTAC和CBTTC)。 2)允许用户识别生物标志物或对基因的表达进行验证。 3)提供图形和情节描述为编码蛋白质的表达谱和患者生存...
UALCAN数据库官网上不去的主要原因可能有:服务器故障、网络连接问题、域名到期、网站被黑、浏览器兼容性问题、区域性限制、维护更新。服务器故障是最常见的原因之一,UALCAN数据库作为一个庞大的数据平台,可能因为服务器超负荷运行或硬件问题导致网站无法访问。 一、服务
UALCAN数据库介绍:表达谱、生存曲线、启动子甲基化、泛癌分析 6571播放 NCBI查找基因启动子区域 1.3万播放 基因的基因组序列查找 1.6万播放 cytoscape 做成分-靶点-通路-疾病-图 7.2万播放 网络药理学-KEGG和GO通路富集分析 7.7万播放 如何用cytoscape做一个美观精致的PPI网络图?下期出string网站的教程,点个关注持续...
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