第一种方法就是上面的txdb对象通过函数处理返回Granges对象! 第二种是自己手动创建 同样的对这个对象也会有很多很多的方法 seqnames(exon_txdb)返回一个class 'Rle' [package "S4Vectors"] with 4 slots,有93个染色体信息,以及每条染色体上面有多少个外显子信息 ranges(exon_txdb)返回外显子的起始终止位点,长度,...
植物构建txdb对象 使用genomicfeatures来构建txdb对象,首先就是安装对应的包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GenomicFeatures", version = "3.8") BiocManager::install("biomaRt", version = "3.8") library("GenomicFeatures") library(...