TWAS方法用于分析与疾病或者特定性状想关联的基因表达,TWAS hub利用该方法分析了数百个复杂性状,并将分析结果做成了数据库,方便检索和查看,数据库网址如下 http://twas-hub.org/ 该数据库使用了FUSION这款软件进行TWAS分析,相关结果通过以下两种方式查看 1. TRAITS 以性状为单位进行查看, 点击右上角的TRA... 查
本文主要对TWAS分析的原理和方法进行了简介。TWAS的优势在于可以找到显著性的基因而不是SNP,因此更具有生物学意义。目前,TWAS已经成功应用于精神分裂症、乳腺癌、前列腺癌等疾病中,相关的数据分析软件除了上文介绍的PrediXcan和MR-JTI外,还有S-prediXcan,、Fusion、 UTMOST等。从文献的分析比较来看,MR-J...
http://twas-hub.org/ 该数据库使用了FUSION这款软件进行TWAS分析,相关结果通过以下两种方式查看 1. TRAITS 以性状为单位进行查看, 点击右上角的TRAITS按钮,会列出所有性状的TWAS结果,示意如下 点击对应的Trait, 可以查看该性状具体的分析结果,以吸烟为例,结果示意如下 列出了所有候选的易感基因。 2. GENES 以性...