限制小鼠饮食蛋白水平能够改变小鼠成熟精子中小RNA含量,let-7表达降低,而Glycine tRNA来源的5’端tRFs&tiRNAs表达量升高。tRFs&tiRNAs被认为在着床前胚胎转录组表达调控中起着内 源逆转录驱动作用9。 图6. 高脂饮食(HFD)小鼠精子中tRNA来源的小RNA (tsRNAs,主要是tRNA halves)具有变化的表达谱和RNA修饰。通过受精...
该课题致力于探索tsRNA在生命过程中的关键作用机制。tsRNA广泛存在于多种生物体内,具有独特的分布特征。研究发现tsRNA的过程涉及特定的酶促反应。不同组织中tsRNA的表达水平存在明显的差异。tsRNA在细胞增殖过程中发挥着潜在的调控功能。某些疾病状态下,tsRNA的表达谱会发生显著改变。对tsRNA的序列分析有助于揭示其功...
传统的小RNA测序建库技术主要检测miRNA、piRNA等,无法检测到含有特殊修饰的小RNA,比如前文提到的tsRNA还有rsRNA都是具有高度修饰的小RNA。PANDORA-seq[5](克服RNA修饰中止的全景RNA展示测序)通过对15-50nt区段的小RNA进行酶学处理(AlkB和T4PNK酶),去除影响测序的修饰,能够完整地呈现包括tsRNA/rsRNA在内的小RNA图谱。
tsRNA简介:一群由18~40个核苷酸的转移RNA(tRNA)切割而成的异质性小非编码RNA,命名为tRNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs, tsRNAs)。tsRNAs参与多种机制,如调节mRNA稳定性、翻译、rRNA合成和RNA逆转录。是蛋白质生物合成期间将氨基酸转运到核糖体的翻译机制的必要部分。目前,越来越多的新tsRNA被鉴定出来,它们...
tsRNA分类分析:seqac包 tRNA的二级结构如下: image-20230903154931207 根据其二级结构,tsRNA分类如下: 早期研究报道,tiRNAs通过血管生成素(ANG)切割成熟tRNA产生,而tRFs来源于Dicer或ANG切割成熟tRNA或tRNA前体。根据成熟或前体tRNA转录本中的裂解位点,可以分为以下几类:...
通过在前缀“ts”之后添加这些字母代码,可以准确地表示tsRNA的来源tRNA。 最后,如果需要区分tsRNA的长度,我们可以在后缀部分添加相关的数字表示。例如,“-18”表示长度为18个核苷酸的tsRNA。 综上所述,tsRNA的命名规则如下:使用前缀“ts”表示“转运RNA衍生的小RNA”,后面根据其来源tRNA和亚型添加相应的字母代码,若...
转移RNA (tRNA) 衍生的小RNA (tsRNA) 是一种新型的非编码小 RNA,可通过酶从 tRNA 上切割下来,在转录和翻译水平调节基因表达。tRNA的化学修饰可以直接影响 tsRNA 的产生和生物学功能。tsRNA参与多种疾病的发病机制,包括免疫紊乱、代谢紊乱和恶性肿瘤的发展,并且是各种疾病的潜在诊断生物标志物和治疗靶点。 tRNA由...
tsRNA是tRNA(转运RNA)在核酸酶RNaseZ或Dicer作用下产生的、长度约18-40个核苷酸的非编码小RNA。已有研究表明,tsRNAs对多种癌症的产生和发展起着至关重要的作用,例如,在B细胞慢性淋巴细胞白血病(CLL)中,ts-3676可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。值得注意的是,tsRNA在血清中比较稳定,其可能是多种疾病(包括胰腺癌、乳腺...
tsRNA参与疾病机制，包括免疫紊乱、代谢紊乱和恶性肿瘤的发展。它们在多种疾病的诊断和治疗中展现出潜力。例如，tsRNA在系统性红斑狼疮中的差异表达，揭示了其在自身免疫性疾病中的作用。另外，精子tsRNA在代谢紊乱的代际遗传中发挥关键角色。在恶性肿瘤中，tsRNA的表达失调现象常见。通过对乳腺癌中tsRNA的...
平台1:tsRNA测序(可以检测tsRNA与miRNA),康成生物是用专门的预处理试剂盒处理,去除修饰的影响,并增加接头修复末端。比普通的small RNA测序更全面更准确的检出tsRNA。 平台2:Arraystar small RNA芯片(可以检测tsRNA、tRNA、miRNA、pre-RNA、snoRNA),是设计序列特异性探针,根据序列设计探针是发夹探针,直接cDNA互补配对...