wget -c http://trna.ucsc.edu/software/trnascan-se-2.0.6.tar.gz tar -zxvf trnascan-se-2.0.6.tar.gz cd tRNAscan-SE-2.0 mkdir bin ./configure --prefix=~/soft/tRNAscan-SE-2.0/bin make conda 安装 conda install trnascan-se -c bioconda 使用前需要将依赖程序链接到指定的目录 cp ~/soft/mini...
安装完成后,您可以通过以下命令验证 tRNAscanSE 是否安装成功: tRNAscan-SE -h AI代码助手复制代码 如果安装成功,您将看到 tRNAscanSE 的帮助信息。 使用tRNAscanSE 1. 基本用法 tRNAscanSE 的基本命令格式如下: tRNAscan-SE[选项]<输入文件> AI代码助手复制代码 其中,<输入文件>是包含基因组序列的 FASTA 格式文件。
tRNAscan-SE使用说明https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/77853662 注意,这个软件是直接通过conda安装的 conda install trnascan-se -c bioconda 安装好之后直接可以使用 对于trnascan-se的使用也非常简单 tRNAscan-SE -B -o 108tRNA.out -f 108tRNA.ss -m 108tRNA.stats XXXXXX108.fas -A 适合于...
$ mkdir tRNAscan-SE-2.0_installed # 跳过此操作安装在解压目录下也可以 $ ./configure --prefix=/user/software/tRNAscan-SE-2.0_installed $ make && make install # 添加bashrc【建议】或者terminal运行 export PATH=/user/software/tRNAscan-SE-2.0_installed/bin:$PATH export PERL5LIB=/user/software/tRNAsc...