Isotype Model : Isotype Score : tRNA 类型: tRNAscan-SE 会根据反义密码子和 Isotype Model 两种方法预测tRNA的类型,对于每个tRNA, 分别给出反义密码子和 Isotype Model 预测的结果,以及两种结果预测的一致性,其中isotype model 会对每一种氨基酸进行打分,选得分最高的作为最终的结果 tRNA 二级结构预测的结果: S...
Through cysteine-directed activity-based protein profiling, azetidine acrylamides, in particular the 2R, 3S isotype, are discovered as stereoselective covalent inhibitors of human NSUN2. Despite targeting the conserved catalytic cysteine residue (C271) shared by NSun family members (NSun1-7 in huma...
总体而言,我们发现微生物组对tRNA表达的影响不仅是组织特有的,而且来自isodecoder-level的差异。 2.Expression-related analyses at the amino acid isotype level 我们进一步分析了tRNA在氨基酸同种型水平上的表达差异(图3A-D)。总的来说,结果表明,四个组织...
A and B boxes within the tDNA coding region show varying consensus sequences depending on the tRNA isotype and lineage. The chloroplast genomes, but not the mitogenomes, possess relatively conserved tRNA gene organization. These findings reveal differences and patterns acquired by ...
*输出的结果里面有两个score,-cove score,最后的一个分值,最低20,是每一个isotype的分值-还有一个infernal score,是用来过滤,提高计算速度的*帮助文件运行 tRNAsecn-SE -h,参考3的说明挺详细。*运行的主要参数包括-选择tRNA类型(默认细菌)-B-不检测是不是假基因 -D-输出文件的类型:+-o <file> 总结果+-f...
RNAscan-SE 会根据反义密码子和Isotype Model两种方法预测tRNA的类型,对于每个tRNA, 分别给出反义密码子和Isotype Model预测的结果,以及两种结果预测结果是否一致(Consistent or Inconsistent)。 在线版本对于较大的序列文件注释速度十分缓慢,因此对于基因组序列推荐使用本地版软件。
(if not specified, only cytosolic isotype-specific model scan will be performed) -I : search using Infernal 使用 Infernal 搜索 default use with -E, -B, -A, or -G; optional for -O 默认与 -E、-B、-A 或 -G 一起使用;-O 为可选项 --max : maximum sensitivity mode - search using ...
tRNAscan-SE 会根据反义密码子和 Isotype Model 两种方法预测tRNA的类型,对于每个tRNA, 分别给出反义密码子和 Isotype Model 预测的结果,以及两种结果预测的一致性,其中isotype model 会对每一种氨基酸进行打分,选得分最高的作为最终的结果 3. tRNA 二级结构 ...
Host / Isotype Rabbit / IgG Class Polyclonal Type Antibody Full Name tRNA selenocysteine 1 associated protein 1 Synonyms PRO1902, RP4 669K10.4, SECP43, TRNAU1AP, TRNAU1AP,SECP43, TRSPAP1 Calculated Molecular Weight 32 kDa Observed Molecular Weight 36 kDa, 21 kDa GenBank Accession Number BC...
tRNAscan-SE 会根据反义密码子和 Isotype Model 两种方法预测tRNA的类型,对于每个tRNA, 分别给出反义密码子和 Isotype Model 预测的结果,以及两种结果预测的一致性,其中isotype model 会对每一种氨基酸进行打分,选得分最高的作为最终的结果 3. tRNA 二级结构 ...