携带同种氨基酸而反密码子不同的tRNAs被称为“isoacceptors”;携带同种氨基酸且反密码子相同,但序列不同的tRNAs则互为“isodecoders”。在真核生物中,isodecoders的数量变化很大,并且在进化过程中增加:例如,在人类中,有50%的tRNA基因编码isodecoders,而在...
高度保守的tRNA isodecoder序列可呈现不同的组织特异性表达,其发挥的功能也具有明显差异。例如,小鼠的5种tRNA-Arg-UCUisodecoders只有一种在中枢神经系统(CNS)中特异性表达(Fig.4A)。它的缺失会引发mRNA上核糖体停滞,ATF4驱动的压力应激反应和广泛的神经变性(Fig.4B, C, D)。因此CNS特异性表达的isodecoder具有维...
因此,在分化的人类细胞中,tRNA反密码子池是通过最稳定表达的主要isodecoder来得到缓冲的。 为了研究这种倾向于表达主要tRNA isodecoder的调控机制,他们用对Pol III的催化核心组分RPC1和招募Pol III到tRNA的TFIIIB亚基BRF1进行了CHIP-seq,构建...
所述的trna+mrna免疫增强型疫苗可应用于制备免疫效果更强的病毒mrna疫苗、肿瘤mrna疫苗,开发蛋白表达水平更高的蛋白替代mrna疗法,也可以应用于赋能其他形式的rna疗法和疫苗,例如环状rna、自复制rna等。本发明还提供一种用于生产抗体的重组细胞,所述重组细胞过表达能够提高抗体表达量的trna,所述trna包括trna isodecoder家...
tRNA isoacceptors是指包括反密码子在内序列不同,但是能够转运相同氨基酸的tRNA;tRNA isodecoders是指具有相同的反密码子但其他序列不同的tRNA。干巴巴的文字看起来太过无趣且费解,还是给大家呈现图片以便于了解,这里还是以Ala-tRNA为例,具体如下图所示。 前面我们提到,Ala有3种tRNA,如上图Isoacceptor families一行...
每个氨基酸由一个或多个 tRNA 解码,称为 isoacceptors,每个都有一个独特的反密码子,一个 isoacceptor 可能有几个不同的 isodecoders。根据 GtRNAdb,人类基因组包含 429 个 tRNA 基因,斑马鱼基因组包含 8676 个 tRNA 基因,这意味着每个 ...
因此,每个氨基酸都存在一个同工受体家族,包括硒代半胱氨酸(一种半胱氨酸类似物,含有硒而不是硫,对硒蛋白的形成至关重要)。相比之下,异源解码(isodecoder)家族是指共享相同的反密码子,但在其结构的其他地方拥有核苷酸差异的tRNA。 有趣的是,在真核生物中,编码异源解码tRNA的数量(作为所有tRNA基因的一小部分)...
isodecoder是反密码子相同但躯干序列不同的tRNA,他们想知道tRNA转录本池和反密码子丰度之间的显著差异是否是由于不同isodecoder的不平等分布所导致的,于是他们计算了主要的isodecoder的数量,发现虽然预测的人类tRNA基因的isodecoder数目在1-26之间,但是在hiPSC中大多数成熟的tRNA反密码子家族是由1-4个主要的isodecoder组...
在摇摆假说的基础上，我们引入了tRNA isoacceptors和tRNA isodecoders的概念。isoacceptors是指序列不同但转运相同氨基酸的tRNA，而isodecoders则是具有相同反密码子但序列不同的tRNA。以Ala-tRNA为例，有3种反密码子，每种反密码子对应多种tRNA，形成了复杂但精确的氨基酸搬运网络。高等生物中存在两套tRNA...
大脑和肠道都显示出大量上调和下调的tRNA(图2C,D);当微生物组存在时,肝脏的差异tRNA大多数上调(图2E),而肾脏显示非常有限的变化(补充图S3)。总体而言,我们发现微生物组对tRNA表达的影响不仅是组织特有的,而且来自isodecoder-level的差异。 2.Expression-r...