count值除以基因长度/每个样本的count值除以基因长度的加和 同RPKM一样,TPM对基因的长度进行了校正,计算比对到基因上的reads/基因长度得到长度校正的表达量 reads per kilobase (RPK)。再以文库中RPK之和作为Scale Factor求出TPM。 相比于RPKM使用read counts之和来作为文库校正因子,TPM使用RPK之和作为文库校正因子的...
相比于RPKM使用read counts之和来作为文库校正因子，TPM使用RPK之和作为文库校正因子的好处是考虑了不同样本间的基因长度的分布。因为RPK是一个对基因长度进行校正后的表达量单位，所以RPK之和也不会再带入基因长度的bias。因此，如果需要比较的样本之间转录本分布不一致时（例如不同物种RNA-seq的比较），...
count值除以基因长度/每个样本的count值除以基因长度的加和 同RPKM一样,TPM对基因的长度进行了校正,计算比对到基因上的reads/基因长度得到长度校正的表达量 reads per kilobase (RPK)。再以文库中RPK之和作为Scale Factor求出TPM。 相比于RPKM使用read counts之和来作为文库校正因子,TPM使用RPK之和作为文库校正因子的...
区别是FPKM考虑到两次读取可以映射到一个片段(因此它不会对该片段进行两次计数)。 TPM与RPKM和FPKM非常相似。唯一的区别是操作顺序。... 遥感中DN、NPTS、total、percent、acc pct指什么 你是在统计(Statistic)中看到的这些量吧,以ENVI中自带的can_tmr.img数据为例DN--代表影像中像元 猜你关注广告 1纳斯达克 ...
count值除以基因长度/每个样本的count值除以基因长度的加和 同RPKM一样,TPM对基因的长度进行了校正,计算比对到基因上的reads/基因长度得到长度校正的表达量 reads per kilobase (RPK)。再以文库中RPK之和作为Scale Factor求出TPM。 相比于RPKM使用read counts之和来作为文库校正因子,TPM使用RPK之和作为文库校正因子的...