https://chrsmrrs.github.io/datasets/docs/datasets/这是TUDdataset的连接通过“/tmp/AIDS”选择想要的数据集。 fromtorch_geometric.datasetsimportTUDatasetdataset=TUDataset(root='/tmp/AIDS',name='AIDS')#下载数据data=dataset#TUDataset数据集data1=dataset[0]#第一个图数据data>>AIDS(2000)#AIDS这个数据集有...
1. 梯度爆炸：这种情况下，梯度值过大，导致权重的更新过于剧烈，模型无法收敛，最终导致训练 loss 为 ...
近年来,图神经网络在基于图的任务中取得了显著的性能,而 GNN 的核心思想是通过聚集局部邻域的信息来获得节点的表示。尽管 GNN 在从局部邻域学习节点表示方面取得了进展,但局部邻域信息是否足以获得有效的节点表示仍然是一个问题,特别是对于邻居数量有限的节点。 本文认为,局部邻域中有限的邻居数量限制了 GNN 的表达能力...
最近需要用到图卷积神经网络(GCN),因此安装了当前比较流行的图神经网络库PyG,按照PyG官方文档的指引用conda先装了torch,再装了PyG,过程很顺利,没有出现问题。 但在安装完成调用时出现了错误,import torch-geometric报错“[WinError 126]找不到指定模块”,如图所示。在网上搜索之后发现有人遇到同样的问题,说是这些依赖...
Cora数据集是一个论文引用网络数据，包含2708篇科学论文。图中的每个节点代表一篇论文，如果一篇论文引用另一篇论文，则有节点间有一条边相连。我们使用PyG (Pytorch Geometric)来实现GCN, GCN是GNN的流行库之一。Cora数据集也可以使用PyG模块加载:from torch_geometric.datasets import Planetoiddataset = Planetoid(root=...
Anaconda2019[python3.7.3]+cuda11.2 + cudnn8.1.0 + tensorflow=2.5.0,tensorflow-gpu=2.5.0(tf25虚拟环境,python3.7.3)+pytorch1.10.0(cu113) + torch-geometric(PYG100虚拟环境,python3.7.13,两个环境及两个环境的python版本不同都是为了防止两个深度学习库对numpy等库的要求不同所以用两个虚拟环境) 【...
torch1.8.1+cu101对应的torch-geometric的torch-scatter、torch-sparse、torch-cluster和torch-spline-conv四个库下载地址 tensorflow 安装GPU版本,CUDA与cuDNN版本对应关系,RTX3050Ti Win10安装GPU版本的Tensorflow 2.1 Could not load dynamic library ‘cublas64_10.dll‘; dlerror: cublas64_10.dll not found ...
真正的图神经网络训练中我们一般是加载数据集中的一部分到内存中训练图神经网络,叫做一个batch,那么PyG如何加载一个batch呢,PyG会根据我们的数据集将其分割为我们指定的batch大小。 举个例子 from torch_geometric.loader import DataLoader from torch_geometric.datasets import TUDataset # 数据集 dataset = TUDataset...
4 torch_geometric 框架简洁代码 输出: 导航栏 前言: GraphSAGE和GCN相比,引入了对邻居节点进行了随机采样,这使得邻居节点的特征聚合有了泛化的能力,可以在一些未知节点上的图进行学习顶点的embedding,而GCN是在一个确定的图中去学习顶点的embedding。 1 图的基本概念(不清楚可以先看这篇GCN文章) Aurora:【图卷积网...