TorchFix是一个专门为PyTorch设计的静态分析工具。他们使用了Lipcea ST这个流行的库。Lipcea ST允许TorchFix加载、获取语法树、更新语法树,然后将修改后的语法树写回。关于如何运行TorchFix,有两种模式。一种是作为Flake8插件,另一种是独立模式。在Flake 8插件模式中,你只需要安装Torchfix,然后基本上使用Flake 8
部分代码: model = model.eval() # 转换成测试模式 # data_X = data_X.reshape(-1, 1, 2) # data_X = torch.from_numpy(data_X) var_test_x = Variable(test_x). cpu() pred_test_y = model(var_test_x) # 测试集的预测结果 # 改变输出的格式 # pred_test = pred_test.view(-1).dat...
TorchProtein 提供了多功能的求解器(solver)来执行模型训练、评测和模型参数保存。 import torchoptimizer = torch.optim.Adam(task.parameters(), lr=1e-4)solver = core.Engine(task, train_set, valid_set, test_set,optimizer, bat...
cuBLAS矩阵乘法性能分析(附代码示例) 使用教程 矩阵乘法是神经网络中最基础、最重要的一个运算。在用CUDA实现矩阵乘法时,不需要我们手动写,cuBLAS库提供了现成的矩阵乘法算子,例如cublasGemmEx和cublasLtMatmul。其中后者是轻量级版本,API调用更灵活。例如对于整...
这个后端的策略 前端 交给社区,可以复用已有代码,后面部分全部通过torch dynamo对接到自己编译系统,而且芯片厂商这方面人才充足,可以和社区形成互补,彼时google刚通过torch xla 支持完vllm 在TPU上的运行,我还是蛮有信心的。实测完却大大超出预期: 1. 首先 H100 上flash infer FP8 要比 triton 快 30% 以上,所以...
golang性能分析go tool pprof 在Go语言中,我们可以通过标准库的代码包runtime和runtime/pprof中的程序来生成三种包含实时性数据的概要文件,分别是CPU概要文件、内存概要文件和程序阻塞概要文件。 CPU概要文件 我们可以通过从样本记录中分析出哪些代码是计算时间最长或者说最耗CPU资源的部分了。我们可以通过以下代码启动...
蛋白质结构性质分析 TorchProtein 也提供了多种用于蛋白质结构性质分析的数据集和模型,以供用户进行模型评估,进而促进蛋白质结构分析的实际应用。 以Enzyme Commission(EC)蛋白质功能预测数据集为例,通过两行代码我们可以轻松构建数据集并获取...
考虑到不同任务需要用到蛋白质分子、序列和结构等不同信息,TorchProtein 设计了一套统一不同模态信息的数据结构。可对蛋白质进行分子、序列或结构层面的操作,并在模态之间进行无缝切换。 灵活的算法构建模块 平台提供了多种基于蛋白质序列与结构的模型,仅需一两行代码即可调用 TorchProtein 中的标准模型来分析蛋白质序...
简介:Mila唐建团队开源大分子机器学习平台TorchProtein:分析蛋白质序列及结构数据,仅需一两行代码 继药物研发机器学习平台 TorchDrug 之后,时隔一年,Mila 唐建团队开源了新的蛋白质机器学习平台 TorchProtein,这是目前第一个专门针对蛋白质研究的开源机器学习库。