TnpB是由IS200/IS605等原核转座子家族编码，在进化上可能是Cas12的祖先，仅含有400-500个氨基酸，作为微型基因编辑工具有较大开发应用潜力，最近中科院动物所王皓毅和张勇研究员团队发现多种TnpB系统可以用于动物以及微生物的基因编辑，但是否能用于植物基因编辑尚不清楚。近日，西北工业大学王文教授与王皓毅和张勇研究员...
TnpB 蛋白存在于多种细菌和古生菌中，其中来自耐辐射球菌的 TnpB 蛋白，能在寒冷、脱水、真空和酸性环境中生存，是最抗辐射的生物之一。虽然紧凑的 TnpB 蛋白已被证明可用于人类细胞的基因组编辑，但其效率较低且靶向能力有限，这是因为结合 DNA 时需要识别。为解决这一问题，苏黎世大学药理学和毒理学研究所的 ...
近日,来自哥伦比亚大学的Samuel H. Sternberg研究团队在Nature上发表了题为TnpB homologues exapted from transposons are RNA-guided transcription factors的文章,研究了TnpB同源物如何从转座子中被外借,成为RNA引导的转录因子,揭示了TnpB基因家...
tnpb原理 TnpB,一种RNA引导的核酸酶,被认为是可编程的。它的祖先TnpB具有切割DNA的能力,且可以通过与特定的RNA引导序列结合进行定向切割。在TnpB的引导下,靠近TTGAT转座相关模块5’端的DNA可以被切割。此外,TnpB还可以切割人类基因组DNA。 TnpB的工作原理是通过与RNA的结合来识别并切割DNA。RNA在TnpB的工作中...
2024年1月27日,上海临港实验室胥春龙,辉大基因周英思以及新加坡国立大学的胡纯一实验室合作在Nature Communications在线发表题为“Engineering a transposon-associated TnpB-ωRNA system for efficient gene editing and phenotypic correction of a tyrosinaemia mouse model”的研究论文,该研究展示了一种突破性的基因编...
该研究通过工程化改造优化了TnpB-ωRNA基因编辑工具,并证明了其能够在小鼠模型中进行高效的体内编辑,而且通过单个腺相关病毒(AAV)向肝脏递送改造后的TnpB-ωRNA,成功实现了对小鼠模型中酪氨酸血症的治疗,预示微型TnpB编辑工具在疾病基因编辑治疗方面的巨大潜力。
该研究还发现TnpB可能是CRISPR-Cas9/Cas12核酸酶的祖先，推测TnpB也具备RNA引导的核酸酶活性。近日，来自立陶宛维尔纽斯大学的Virginijus Siksnys团队（CRISPR开创者之一，通过研究CRISPR-Cas9 生化性质，得出了Cas9酶可以定点切割DNA的结论，特别致敬CRISPR幕后的英雄们——最全的一份CRISPR英雄谱）在Nature杂志上在线发表...
TnpB虽然被证明能用于人细胞基因组编辑,但活性低于Cas核酸酶(尤其是Cas9),并且复杂的TAM基序限制了其应用。 来自Deinococcus radiodurans的TnpB(称为ISDra2)是第一个在哺乳动物中被部署为基因组编辑工具的。因…
TNPB修饰的实施需要在DNA的两端引入TNPB。这一步可以通过两种方法实现:一是在引物合成时直接加入TNPB,二是在PCR扩增过程中用包含TNPB的dNTP进行标记。 第一种方法中,引物合成时已经合成了带有TNPB的引物,其具有与目标DNA序列互补的序列并在其末端含有TNPB。这样,在PCR扩增时,引物会与待检测DNA序列结合,并在扩增...
我们利用来自耐辐射奇球菌的 TnpB 核酸酶开发了一种超紧凑基因组编辑器。这种细菌以其在极端环境中生存的能力和对辐射的卓越抵抗力而闻名。我们的 TnpB 源自耐辐射奇球菌，长度仅为 408 个氨基酸。一个短 RNA 充当 TnpB 的向导，将其引导至目标 DNA 序列。在这种 RNA 的引导下，TnpB 会与目标结合并切割 DNA...