病原靶向测序技术(Targeted Next Generation Sequencing, tNGS),是一项通过超多重PCR技术,靶向扩增标本中的病原体核酸序列,并进行高通量测序,经过与病原数据库比对和生信分析,一次性检测临床常见的病原体以及部分耐药基因,可覆盖临床99%常见感染病原体,快速辅助临床各种感染的精准诊疗。简而言之,就是凭借该项技术检查患...
tNGS:只针对特定基因序列进行测序,因此检测范围相对较窄。 mNGS:可以检测所有已知基因组序列的病原体,因此检测范围广泛。 灵敏度与准确性 tNGS:由于只针对特定基因序列进行测序,因此具有高灵敏度和准确性。 mNGS:虽然覆盖范围广,但可能受到人源干扰和背景菌群的影响,导至灵敏度和准确性略有降低。不过,随着技术的不断...
而tNGS可以通过引物或探针对耐药基因及毒力基因进行富集测序,检测出耐药及毒力[2-4]。 tNGS作为最近两年才开始大量应用于临床的一种新技术,已经被临床广泛接受,个人认为可能很快会取代mNGS的地位,毕竟价格便宜,价格是王道。另外还有一个重要因素,无论tNGS还是mNGS目前国内都没有获得NMPA认证的产品,但相比于mNGS几万种...
第1例患者tNGS未检出结核,我院经过Xpert和分枝杆菌培养明确,后2例为弥漫性间质性肺炎是否合并感染的鉴别诊断,tNGS能在很短时间内明确患者是否合并感染,利于呼吸衰竭的患者尽快明确病原学,第4例为发热患者的鉴别诊断,因肺部CT不典型,常规抗感染无效,tNGS常常能告诉我们发热的原因。 严重的肺部感染,亟需病原学来指导...
这里借用一下中国食药鉴定研究院对于靶向测序的描述,病原靶向测序(tNGS)通过超多重PCR扩增与高通量测序两种技术的结合,能够对待测样本中几十种至几百种已知病原微生物及其毒力和/或耐药基因进行检测。对低浓度的病原微生物的检测,特别是其毒力和/或耐药基因检测,与病原宏基因组测序(mNGS)相比,tNGS具有病原谱范围...
tNGS 技术展望的突破点可能包括以下几个方面: 检测成本降低:通过技术改进和规模效应,降低检测费用,使其更广泛应用。 提高检测速度:缩短检测时间,满足临床快速诊断的需求。 拓展检测范围:覆盖更多的病原体和基因变异。 增强准确性和特异性:减少假阳性和假阴性结果。
tNGS 可在增加样本中病原微生物信息、提高灵敏度的前提下大大减少测序数据量,从而实现性能及成本的双重优化。因此,mNGS 更适用于检测不可预见病原体的场景,而 tNGS 则更适用于分析灵敏度要求更高的场景。相比于 mNGS,tNGS 病原检测有如下技术优点[3-5]:...
病原靶向测序(tNGS)通过超多重PCR扩增与高通量测序两种技术的结合,能够对待测样本中几十至上百种已知病原微生物及其毒力和/或耐药基因进行检测。对低浓度的病原微生物的检测,特别是其毒力和/或耐药基因检测,与病原宏基因组测序(mNGS)相比,tNGS具有病原谱范围明确、测序成本低等优势。...
TNGS(Targeted Next-Generation Sequencing)检测技术是一种高通量测序技术,能够对特定基因区域进行深度测序,从而实现对个体基因组的全面分析。本文将从TNGS检测技术的原理、应用以及优缺点等方面进行阐述。 一、TNGS检测技术的原理 TNGS检测技术主要基于Illumina测序平台,通过将目标DNA片段进行多轮PCR扩增,得到大量的DNA片段...
tNGS在临床上的表现直击mNGS的痛点,样本测序数据量约为mNGS的千分之一,可以同时兼顾DNA与RNA的检测,降低了时间和成本,其次tNGS检测范围仅包含预先设定的致病病原体,PCR产物不包含人源基因片段及背景菌群基因片段,因此不会受到人源干扰和背景菌群的影响,也降低了报告...