转座子测序(transposon sequencing,Tn-seq)技术结合了转座子插入诱变和二代测序技术,常被用于细菌基因功能的研究。 转座子测序需要构建一个转座子插入文库,其中大多数或所有非必需基因(non-essential genes)都包含插入物,然后在特定的体外或体内(宿主感染)条件下培养。通过测序确定实验的开始和结束时种群中每个突变体...
通过Tn-seq 的方法,研究人员已成功用于分析多种细菌的生长必需基因以及促进细菌在各种体内外的环境中生存的重要基因,如致使肺炎双球菌增长基因、假单胞菌耐药基因等。目前的研究中,尚未有 Tn-seq 用于金黄色葡萄球菌 VBNC 状态的研究。本研究将利用该技术确定控制金黄色葡萄球菌进入 VBNC 状态的基因,此外,在全基因组...
Tn-seq (Transposon sequencing) 是一种革命性的高通量测序技术,专门用于解析细菌基因组中转座子的插入位置和频率。这一技术巧妙地将转座子突变与高通量测序相结合,从而帮助科学家们精准识别与细菌生长、适应性和致病性密切相关的基因。 通过比较不同环境条件下转座子插入位点的丰度变化,Tn-seq 能够揭示哪些基因或基...
Tn-seq转座子测序技术服务介绍: 对基因功能的了解落后于基因发现阻碍了我们对微生物表型遗传基础的理解。 大规模并行测序与传统的转座子诱变相结合的转座子测序(Tn-seq),可以以高通量的方式鉴定推定的基因功能。 转座子测序需要构建一个转座子插入文库,其中大多数或所有非必需基因(non-essential genes)都包含插入...
本研究通过Tn-seq技术揭示了鲍曼不动杆菌在不同感染模型中的关键致病基因,为新型抗菌药物靶点开发提供了重要依据 鲍曼不动杆菌(Burkholderia cenocepacia)是一种具有高度传染性和固有抗生素耐药性的机会性病原体,常在医院中引发感染爆发,尤其对免疫受损患者和囊性纤维化(cystic fibrosis, CF)患者构成严重威胁。本研究旨在...
转座子测序技术（Tn-seq）是一种结合了转座子插入诱变与二代测序技术的高效研究方法，主要用于细菌基因功能的深入探究。此技术的核心是构建转座子插入文库，其中大部分或全部非必需基因（non-essential genes）均携带插入片段。通过特定体外或体内培养，测序确定实验前后种群中突变体的相对频率。从数据中，...
Tn-seq: high-throughput parallel sequencing for fitness and genetic interaction studies in microorganisms. Nat. Methods 6, 767-772, doi:10.1038/nmeth.1377 (2009).van Opijnen, T., K. L. Bodi, and A. Camilli. 2009. Tn-seq: high-throughput parallel sequencing for fitness and genetic ...
Tn-seq!细菌功能验证经典技术 2024-03-05 网址: 凌波微视 下一篇:科学探索本身就是一场冒险! 这不,新学期它来啦~ 上一篇:对人肠道宏病毒组进行三代测序能得到什么?超长序列+甲基化信息!真真是一举两得~
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While I introduce my research and give an overview of Tn-seq, download and unzip the data file we'll be using: mkdir ~/data sudo mkfs.ext4 -E nodiscard /dev/xvdc sudo mount /dev/xvdc ~/data sudo chown ubuntu ~/data cd ~/data wget http://dib-training.ucdavis.edu.s3.amazonaws....