2004年,张阳与导师 Skolnick设计出template modeling score,也就是 TM-score(公式14),评估全长模型的预测,消除蛋白质的大小对结构打分的影响;更重要地,TM-score 可判断2个相比较的结构是否属于同一 fold,即在整体结构或拓扑层级评价结构。[5] 相对于 LG-score,MaxSub 去掉了未匹配残基的空位罚分(gap penalty),...
This article aims to answer two questions: (i) what is the statistical significance of TM-score? (ii) What is the probability of two proteins having the same fold given a specific TM-score? Results: We first made an all-to-all gapless structural match on 6684 non-homologous ...
129 -- 20:14 App g2-TM-Score(WQL) 131 1 23:42 App g3-TM-Align 164 -- 33:02 App j2-X射线散射 79 -- 1:19:56 App k1-RNA静电学(谭志杰) 45 -- 32:50 App e4-HMM 68 -- 58:04 App c1-进化树 103 -- 50:56 App i1-从头算预测 57 -- 36:49 App f2-序列谱 ...
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TM-Score of the best decoy as generated by Flib+SAINT2 and by NNMake +SAINT2.Saulo, H. P. de OliveiraJiye, ShiCharlotte M., Deane
TM-align是由zhang yang LAB开发的一款做蛋白结构比对的软件。 下载链接:http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/TMtools20170708.tar.gz平台:Linux 下载下来的为TMtools,压缩包里包含TM-align及TM-score的可执行文件及编译文件。 如果嫌安装麻烦,那你就可以使用可执行文件,但是作者推荐重新对两个工具进行...
TM-align是由zhang yang LAB开发的一款做蛋白结构比对的软件。 下载链接:http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/TMtools20170708.tar.gz平台:Linux 下载下来的为TMtools,压缩包里包含TM-align及TM-score的可执行文件及编译文件。 如果嫌安装麻烦,那你就可以使用可执行文件,但是作者推荐重新对两个工具进行...
Article-InfluenceTM-Score网络论文影响分值 网络释义 1. 论文影响分值 ...子分值(EigenfactorTM Score)、论文影响分值(Article InfluenceTM Score)的期刊影响力,列出了13种食品科学与技术超级核心 …d.wanfangdata.com.cn|基于6个网页© 2024 Microsoft 隐私声明和 Cookie 法律声明 广告 帮助 反馈...
TM-align is applied to an all-against-all structure comparison of 10 515 representative protein chains from the Protein Data Bank (PDB) with a sequence identity cutoff <95%: 1996 distinct folds are found when a TM-score threshold of 0.5 is used. We also use TM-align to match the models...
Universal Structure Alignment of Monomeric and Complex Structure of Nucleic Acids and Proteins - USalign/TMscore.h at master · pylelab/USalign