TIMER(Tumor Immune Estimation Resource)是一个免疫浸润分析的综合网站,旨在帮助研究人员评估肿瘤组织中的免疫浸润情况。该网站提供了一个可视化的界面,允许用户输入基因表达数据以及其他相关信息,然后使用不同的算法和模型来估计不同类型的免疫细胞浸润情况,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞、NK细胞、树突状细胞等等,对于肿瘤免...
TIMER(Tumor Immune Estimation Resource)是一个免疫浸润分析的综合网站,旨在帮助研究人员评估肿瘤组织中的免疫浸润情况。该网站提供了一个可视化的界面,允许用户输入基因表达数据以及其他相关信息,然后使用不同的算法和模型来估计不同类型的免疫细胞浸润情况,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞、NK细胞、树突状细胞等等,对于肿瘤免...
TIMER(Tumor Immune Estimation Resource)是一个免疫浸润分析的综合网站,旨在帮助研究人员评估肿瘤组织中的免疫浸润情况。该网站提供了一个可视化的界面,允许用户输入基因表达数据以及其他相关信息,然后使用不同的算法和模型来估计不同类型的免疫细胞浸润情况,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞、NK细胞、树突状细胞等等,对于肿瘤免...
TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)数据库也是用高通量测序(RNA-Seq表达谱)数据分析肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况,主要提供B cells, CD4+ T cells, CD8+ T cells, Neutrphils, Macrophages and Dendritic cells等六种免疫细胞的浸润情况。界面友好,简单易学又方便。网址:https://cistrome.shinyapps.io/timer/...
所以,作者研发了肿瘤免疫评估资源:TIMER(TumorImmune Estimation Resource)。来全面研究肿瘤免疫相互作用的分子特性。首先作者从32种癌症类型中的10897个癌症样本计算,评估处6个肿瘤亲润性免疫亚群的水平。TIMER提供了6中主要的分析类型,允许用户交互式的探索免疫亲润组织和各种因素影响之间的关系:包括基因表达临床产出,体...
TIMER(Tumor Immune Estimation Resource)是用高通量测序(RNA-Seq表达谱)数据分析肿瘤组织中免疫细胞浸润的数据库,主要提供B cells,CD4+ T,CD8+ T(淋系);Neutrphils,Macrophages 和 Dendritic cells(髓系)等六种免疫细胞在肿瘤微环境中浸润情况的分析。界面友好,简单易学又方便。
TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)数据库也是用高通量测序(RNA-Seq表达谱)数据分析肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况,主要提供B cells, CD4+ T cells, CD8+ T cells, Neutrphils, Macrophages and Dendritic cells等六种免疫细胞的浸润情况。界面友好,简单易学又方便。网址:https://cistrome.shinyapps.io/timer...
REF:Li T, Fan J, Wang B, et al. TIMER: A Web Server for Comprehensive Analysis of Tumor-Infiltrating Immune Cells. Cancer Res. 2017;77(21):e108‐e110. doi:10.1158/0008-5472.CAN-17-0307
这个人就是来自中国的生物信息领域科学家刘小乐,目前供职于美国哈佛大学及Dana-Farber癌症研究所教授实验室,这个开发的神奇网站叫TIMER(Tumor Immune Estimation Resource)。 网址:https://cistrome.shinyapps.io/timer TIMER是利用RNA-Seq表达谱数据检测肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况。相较于TCIA展示了20种免疫细胞浸润比...
今天来介绍一个使用非常方便的在线分析工具——TIMER (Tumor Immune Estimation Resource),是由哈佛大学免疫信息学教授刘小乐领导建立的一个网站工具专门用于肿瘤浸润免疫细胞分析,网址: https://cistrome.shinyapps.io/timer/ 桓峰基因的教程不但教您怎么使用,还会定期分析一些相关的文章,学会教程只是基础,但是如果把分析...