转录因子:转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。 转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子调节基因表达时,与基因模板链结合的区域。按照常识,转录因子(transcription factor,TF)的结合位...
该基因编码一种分子量约为76.5 kDa的糖蛋白。它被认为是由于一个古老的基因复制事件而产生的,该事件导致了同源的C和N端结构域的产生,每个结构域结合一个铁离子。这种蛋白质的功能是将铁从肠、网状内皮系统和肝实质细胞运输到体内所有增殖细胞。这种蛋白质也可以作为粒细胞/花粉结合蛋白(GPBP)的生理作用,涉及去除血...
大体如下,先提取所有转录本的启动子序列,然后再提取目标基因集合的启动子区域序列。 随后,提取目标基因集合的启动子区域序列 使用Fimo 构建基因调控网络 使用上述文件,一切搞定 运行后很快就可以看到结果 可以看到 Alt ID 对应的似乎 TF,Sequence Name 对应的是启动子上有对应 TF binding motifs 的基因。 如此,我们就...
这种基因称为TF基因,它编码了一种重要蛋白质,参与机体的神经肌肉信号传导。当TF基因发生突变时,蛋白质的功能受到损害,从而导致神经肌肉系统的异常。 TF家族疾病主要包括三个亚型:TF1型、TF2型和TF3型。每个亚型的症状和严重程度都有所不同。TF1型是最常见的亚型,症状在婴儿期开始出现,通常表现为进行性肌肉无力和步...
首先,TF结合位点可以直接作用于基因启动子区域,调节基因的转录起始。基因的启动子区域通常位于基因的上游区域,其中包含转录开始位点和与转录因子结合的序列。TF结合位点通过与转录因子相互作用,增强或抑制基因的转录活性。这种直接的调控机制使得基因家族中相关基因在转录水平上可以同时调节。 其次,TF结合位点还可以通过建立...
根据查阅的文献,椰菜君没有看到一例被诊断为自闭症的Char综合征患者,GeneReviews的这篇重要文献(作者即是发现Char综合征病因的那位)在概括Char综合征症状的时候,也没有提及自闭症,甚至都没有提及发育迟缓,其原因可能是TFAP2B基因主要在胚胎的面部、心脏和四肢结构正常形成中发挥作用,并不参与大脑神经发育。因此,假如...
该基因编码一个转录因子家族的成员,该转录因子与E2F蛋白异二聚体以增强其DNA结合活性并促进来自E2F靶基因的转录编码的蛋白质作为这个复合物的一部分,控制着许多参与细胞周期从g1期到s期进展的基因的转录活性。选择性剪接导致多个转录变体该基因的假基因存在于1号、15号和X号染色体上。
探索基因序列的奥秘:CDS、Exon、Intron、UTR、ORF、启动子与TF的深度解析 基因的密码隐藏在复杂的序列中,每个术语都是构成生命密码链上的一环。让我们一起解开这些名词背后的科学逻辑,看看它们如何共同编织生命的编年史。逻辑关系的交织在基因的舞台上,转录、剪切和翻译是关键的戏剧动作。基因区分为编码...
该基因编码凝血因子iii,它是一种细胞表面糖蛋白。该因子使细胞启动凝血级联反应,并作为凝血因子VII的高亲和力受体发挥作用由此产生的复合物提供了一种催化事件,该催化事件负责通过特定的限制性蛋白水解引发凝血蛋白酶级联。与这些蛋白酶级联的其他辅因子不同,这些辅因子作为非功能性前体循环,当在细胞表面表达时,这个因子...
编码序列(CDS)是直接与蛋白质序列对应的DNA片段,没有其他非编码序列,更接近真实情况。非翻译区(UTR)则位于mRNA两端,包括5'UTR和3'UTR,对翻译过程有影响。启动子与起始密码子、终止子与终止密码子是两个不同的概念:启动子负责调控基因转录,起始密码子则指示翻译的开始,而终止子和终止密码子则...