该基因编码一种分子量约为76.5 kDa的糖蛋白。它被认为是由于一个古老的基因复制事件而产生的,该事件导致了同源的C和N端结构域的产生,每个结构域结合一个铁离子。这种蛋白质的功能是将铁从肠、网状内皮系统和肝实质细胞运输到体内所有增殖细胞。这种蛋白质也可以作为粒细胞/花粉结合蛋白(GPBP)的生理作用,涉及去除血...
转录因子:转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。 转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子调节基因表达时,与基因模板链结合的区域。按照常识,转录因子(transcription factor,TF)的结合位...
大体如下,先提取所有转录本的启动子序列,然后再提取目标基因集合的启动子区域序列。 随后,提取目标基因集合的启动子区域序列 使用Fimo 构建基因调控网络 使用上述文件,一切搞定 运行后很快就可以看到结果 可以看到 Alt ID 对应的似乎 TF,Sequence Name 对应的是启动子上有对应 TF binding motifs 的基因。 如此,我们就...
根据查阅的文献,椰菜君没有看到一例被诊断为自闭症的Char综合征患者,GeneReviews的这篇重要文献(作者即是发现Char综合征病因的那位)在概括Char综合征症状的时候,也没有提及自闭症,甚至都没有提及发育迟缓,其原因可能是TFAP2B基因主要在胚胎的面部、心脏和四肢结构正常形成中发挥作用,并不参与大脑神经发育。因此,假如...
CHOK1细胞TF基因过表达稳转株是通过将目标基因稳定整合到宿主细胞的基因组中,从而实现该基因的持续、高效表达的细胞系。这种稳转株广泛应用于基因功能研究、药物筛选、蛋白质生产等领域。 传代方法 1:3-1:6,每2-3天换液一次 传代周期 48-72h 细胞描述 转导方法:蛋白电转 克隆类型:纯合子 细胞鉴定:PCR...
miRNA - TF - 基因关键调控网络:研究人员构建了关键调控网络,该网络可阐明关键因子对麻黄碱生物碱、黄酮类、单萜类等 SMs 生物合成的调控作用。不同关键调控基因在 ES 或 ER 中的表达偏好影响终产物积累,导致麻黄茎根代谢物组成差异巨大。 研究结论与讨论部分指出,该研究深入探讨了麻黄茎根差异代谢物的动态生物合...
TFⅡ是转录前因子Ⅱ,主要参与RNA聚合酶Ⅱ的转录过程,它也由多个亚基组成,其中包括TFⅡA、TFⅡB、TFⅡD、TFⅡE、TFⅡF等。 TFⅢ是转录前因子Ⅲ,主要参与RNA聚合酶Ⅲ的转录过程,它也由多个亚基组成,其中包括TFⅢA、TFⅢB、TFⅢC等。 总体来说,基于不同的转录聚合酶和启动子区域,真核基因转录因子(tfⅰ、...
1. 基于 10x Genomics scRNA-Seq 预测 TF 靶基因的工作流程 为了预测 TF 结合的靶基因,作者收获 3 周龄的水稻幼苗叶片,消化成原生质体后,利用 PEG-介导转染法,将 TF 质粒导入原生质体进行表达,然后利用 10x Genomics 平台对单个细胞中的 RNA 进行捕获,利用每个细胞中 TF 的瞬时表达差异来捕获相关的潜在靶基因...
16. 睾丸女性化由X染色体上的tf基因决定,患者性染色体组成为XY,有囊丸和女性生殖器官,外貌和正常女性一样,但没有生育能力,性别鉴定为女性。下图是一个睾丸女性化家系的部分系谱图,相关叙述正确的是( ) A. 图中所有患者的母亲均为杂合子 B. 患者家系中女性常多于男性 C. III1和III2再生一个孩子,其患病的概...
5. 提取我们关注的基因 上一步中,我们将GRCh38.gene.promoter.U1000D200.TF_binding.txt文件中的基因名和TF名都转换成了大写。 为了接下来提取目标基因转录因子时不会因大小写差别而漏掉某些基因,我们将targetGene.list中的基因名也全部转换成大写。 代码语言:javascript ...