免疫组库(Immune repertoire,IR)是指在任何指定时间,某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的BCR和TCR的总和。 T淋巴细胞(T cells)和B淋巴细胞(B cells)是负责适应性免疫应答的主要细胞,其抗原识别主要依赖于T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)。这两类细胞表面分子的...
BCR是B细胞表面的受体分子,用于识别和结合抗原。BCR由两个重链和两个轻链组成,其特异性由重链的可变区域(VH区)决定。BCR测序主要是通过测定VH区序列来分析B细胞受体的多样性和克隆性。 1. 提取DNA和RNA 与TCR测序类似,首先需要从样本中提取B细胞的DNA和RNA。 2. 扩增VH区序列 使用PCR方法扩增VH区序列。PCR反应...
TCR/BCR作为T/B细胞克隆的一个独特标记,能够随着时间的变化来跟踪T细胞和B细胞,表征免疫系统的多样性,评估疾病状态及治疗动态的情况。随着免疫组库测序技术越来越成熟,其在血液肿瘤MRD监测、疾病早期诊断、免疫重建评估等方面发挥了越来越重要的作用。
主要介绍一下BCR,因为TCR的情况和BCR相似。 B细胞抗原受体(BCR)是一种长在B淋巴细胞表面的免疫球蛋白分子(IG),这个IG分子的二维结构长得像一个树杈,如下图。它包含了两条重链(H)和两条轻链(L)。重链包含了一个可变区(VH)和3个恒定区(CH1/CH2/CH3),轻链则包含了一个可变区(VL)和一个恒定区(CL)。我...
对于TCR或者BCR而言,使用多重PCR进行扩展和富集,如下图。 对文库进行测序,测序文库结果如下,Read1和Read2测150bp,需要测通。每个细胞推荐测5000对序列。 06.标准分析流程 使用的软件是cellranger,命令是mkfastq和vdj。下面我们来介绍下细节。 mkfastq命令为:cellranger mkfastq --id=tiny_bcl --csv=my_samples...
服务介绍 公司简介 免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指机体内 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞多样性的总和,反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力。基于 10X Genomics 的单细胞系统,可实现高通量的单细胞转录组和 V(D)J 测序。不但可以将 TCR/BCR 双链匹配,而且能够同时获得基因表达信息。 技术原理...
真实样本的 TCR/BCR 多样性分析 不同人类个体在免疫多样性组合分布上存在一定的个性化特征,但如果长期保持一种单调分布模式,即少部分组合占比特别高,则可能提示个体免疫系统功能的整体水平较低。反之,若频度丰富,则提示个体免疫系统功能的整体水平较高。基于124 例真实样本的IGTR Panel捕获结果,我们使用 VDJtools 计算...
然后开始启动T细胞前受体即前TCR(Pre-TCR)和B细胞前受体即前BCR(pre-BCR)的发育,尽管这些受体此时并不具有抗原识别能力。 抗原受体基因的重排和表达 抗原受体基因重排是淋巴细胞发育中的重要事件,直接涉及多样性受体库的产生、发育,以及淋巴细胞是选择成活还是死亡。 对任何一个完成发育的淋巴细胞,其可变区基因片段...
比较TCR、BCR功能表达的生态性,重点在于指出其CD系统表面分子的异同;CD45在TCR、BCR的活化中都有作用,而只在TCR中发生作用的有CD4/CD8、CD2、CD28等;只在BCR中发生作用的有CD22、CD19、CD21等,已有大量的实验资料表明:这些分子参与TCR、BCR活化的作用是不可缺少的。由此可以看出:TCR与BCR识别抗原机制在分子水平...