而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特异性,有助于解析生物体抵御病原微生物入侵的免疫机制。将scRNA-seq与TCR/BCR-seq相结合,可一次性获得大量单细胞的基因表达和免疫组库数据,从而从多个维度深...
BCR/TCR 存在一块区域称作互补决定区(Complementary Determining Region,CDR),在抗原识别中起关键作用;CDR 由 CDR1,CDR2,CDR3 组成,CDR1 和 CDR2 都是由 V 基因编码,而 CDR3 则由 V、D、J 三个基因编码形成,CDR3 多样性程度最高。因此,常通过对 CDR3 区基因序列的研究,对疾病诊断、监测 MRD、免疫评估...
主要功能是作为信号传导分子转导抗原与BCR结合产生的信号,参与Ig从胞内向胞膜的转运。 扩展资料 TCR中没有高频突变机制,因此相对BCR而言,其CDR1,CDR2的变化仍限于种系基因中不同V基因片段的变化。在TCR的Va、VB基因发生体细胞高频突变是可能的,但为数毕竟不多,而且迄今不清楚这些突变基因是否能表达为细胞表面的TCR...
结果表明，在两组队列中，BCR和TCR克隆型的数量、均一性、Gini指数、克隆扩增等特征均伴随样本的雌激素受体水平(HR+/-)、PAM50基因分型和肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）水平等的不同而呈现高度的异质性。统计表明，BCR克隆型的均一性和Gini指数等指标和治疗的无事件生存期(EFS)有显著关系。研究还结合BCR克隆型与多种...
与之相比,BCR是B细胞表面的受体分子,也由两个亚基组成:重链和轻链。重链包含一个可变区域(VH区)和一个常变区域(CH区),轻链包含一个可变区域(VL区)和一个常变区域(CL区)。BCR的VH区和VL区负责与抗原结合,而CH区和CL区则负责传递信号。 TCR和BCR的结构都具有可变区域和常变区域的特点,这使它们能够识别和结...
(Immune repertoire,IR)是指在任何指定时间,某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的BCR和TCR的总和。 T淋巴细胞(T cells)和B淋巴细胞(B cells)是负责适应性免疫应答的主要细胞,其抗原识别主要依赖于T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)。这两类细胞表面分子的共同特点...
BCR是一种膜上受体,存在于B细胞的细胞膜上。它由两个亚基组成,分别是重链和轻链。BCR的结构与TCR类似,也包含可变区和恒定区。可变区的序列也会在B细胞发育过程中发生基因重组,使得每个B细胞都能产生不同的BCR。BCR通过其可变区与抗原结合,从而激活B细胞并引发免疫应答。 TCR和BCR的结构和功能有一些区别。首先,...
Spatial VDJ 技术是 Visium 空间基因表达 (Spatial GEX) 针对新鲜冷冻组织的扩展，利用带有oligodT的3' 靶向条形码序列捕获组织切片中聚腺苷酸化 RNA。在片段化步骤之前，带有空间条形码全长 Visium cDNA 通过磁珠杂交捕获等步骤特异性地富集TCR与BCR序列，然后对富集序列和空间条形码进行测序，确定抗原受体转录本的克隆...
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指机体内 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞多样性的总和,反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力。基于 10X Genomics 的单细胞系统,可实现高通量的单细胞转录组和 V(D)J 测序。不但可以将 TCR/BCR 双链匹配,而且能够同时获得基因表达信息。
本文将介绍TCR和BCR测序的原理和应用。 一、TCR测序原理 TCR是T细胞表面的受体分子,用于识别和结合抗原。TCR由两个重链和两个轻链组成,其特异性由重链的变异区域(V区)决定。TCR测序主要是通过测定V区序列来分析T细胞受体的多样性和克隆性。 1. 提取DNA和RNA 需要从样本中提取T细胞的DNA和RNA。这可以通过标准的...