BATMAN-TCM的核心思路是将中药复方含有的有效成分的结构式与目前已有的成药化合物进行比对,对相似度进行打分,从而用已有药物的作用靶点来预测中药复方所含化合物的潜在靶点。详细的算法是比较复杂的,例如Random Forest之类的算法,大家可以移步郭博士的论文或者BATMAN-TCM的在线tutorials学习,接下来讲讲我们如何在线操作BATMA...
BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine)是一个通过中药复方的组成成分分析化合物与作用靶点的关系,并对作用靶点的作用通路和疾病进行相关联系的中药靶点数据库。它不仅可以用来分析现有中药复方成分分子机制,还可以自定义配方组成成分来进行靶基因预测和网络分...
通过BATMAN-TCM，研究者可以分析中药复方的组成成分与化合物、作用靶点之间的关系，同时关联作用靶点与疾病。该数据库不仅支持分析现有中药复方的分子机制，还允许用户自定义配方的组成成分，进行靶基因预测和网络分析。该数据库具有强大的功能，如预测每个查询中药成分的潜在目标、进行功能分析（包括Gene Ontolog...
BATMAN-TCM可以获取配方、单味或多味中药、单个或多个成分的靶点,并对靶点进行富集分析,自动生成可视化图网址:http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/, 视频播放量 42、弹幕量 0、点赞数 2、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 e嘉医, 作者简介 生物信息学
BATMAN-TCM的核心功能是通过将中药复方中的有效成分与已知药物进行结构比对，计算相似度评分，预测潜在靶点。这有助于揭示中药复方的多效性与复杂性。用户在使用BATMAN-TCM时，首先需输入感兴趣的中药名称或方剂。系统支持直接输入复方名称（拼音）、中草药名称（拼音）或化合物ID。以麻黄汤为例，用户应输入...
BATMAN TCM 数据整理, 视频播放量 7213、弹幕量 22、点赞数 133、投硬币枚数 76、收藏人数 306、转发人数 88, 视频作者 自溺散仙, 作者简介 追求烟火气,边卷边生活。,相关视频:从图片中提取数据WebPlotDigitizer,切包皮不用刀,自动切包皮神器,咔嚓一下就搞定了,sprun
在BATMAN-TCM 2.0中,用户可以选择“通过中药检索靶标”或者“通过基因检索草药/成分”,前者可指定查询的中药是“复方”、“草药”还是“化合物”,BATMAN-TCM 2.0目前支持54,832味复方、8404味草药和39171个中药化合物的检索与浏览,后者支持多种常见基因的标识符格式(图3 A、D)。
BATMANTCM提供了四大部分功能，旨在深入理解中药的组合治疗机制，并为后续实验验证提供线索，加速中药分子机制的阐明。通过结合中药成分的靶标预测和深入的网络药理学分析，该工具支持用户输入中药复方名称、中药名称或CID号来分析其分子机制。预测过程基于TCMID数据库中的复方-中草药-成分关联数据，覆盖了广泛的...
国内科学家开发了首个中药分子作用机制的网络药理学在线分析工具BATMAN-TCM (a Bioinformatics Analysis Tool of Molecular mechanism of Traditional Chinese Medicine)。 BATMAN-TCM的主要功能包括:1、中药组成成分的靶标预测;2、潜在靶标的功能分析;3、成分-靶标-通路/疾病关联网络的可视化;4、中药不同组分的比较分析...
中药清肺排毒汤的TCM-BATMAN生物信息学分析旨在从基因水平上验证其治疗新型冠状病毒（2019-nCoV）的有效性。研究运用了TCM-BATMAN工具和STRING工具进行生物信息学分析，构建了PPI网络，以探讨清肺排毒汤的作用机理。结果揭示，清肺排毒汤的主要作用通路涉及神经活性配体-受体相互作用、钙离子信号、氨基酸代谢、...